More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1039 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  100 
 
 
343 aa  702    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  100 
 
 
343 aa  702    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  58.19 
 
 
345 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  58.67 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  52.8 
 
 
341 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  52.79 
 
 
344 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  55.59 
 
 
343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  53.69 
 
 
353 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  51.91 
 
 
353 aa  350  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  52.71 
 
 
340 aa  342  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  49.85 
 
 
357 aa  339  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  51.04 
 
 
344 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  49.12 
 
 
343 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  50.6 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  50.44 
 
 
359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  53.03 
 
 
359 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  46.92 
 
 
338 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  47.63 
 
 
337 aa  325  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  47.06 
 
 
334 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  48.24 
 
 
334 aa  322  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  47.35 
 
 
337 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  47.51 
 
 
337 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  52.23 
 
 
338 aa  321  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  47.51 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.71 
 
 
344 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  47.37 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  50.74 
 
 
339 aa  319  5e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  50.58 
 
 
348 aa  319  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  47.21 
 
 
337 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  46.51 
 
 
344 aa  318  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  47.06 
 
 
337 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  47.06 
 
 
337 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  47.21 
 
 
333 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  46.92 
 
 
337 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  49.23 
 
 
333 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  48.64 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  49.23 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  49.23 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  51.32 
 
 
343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  48.64 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  48.79 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  48.92 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  49.23 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  48.64 
 
 
333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  46.47 
 
 
343 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  48.34 
 
 
333 aa  311  9e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  48.34 
 
 
333 aa  311  9e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  48.34 
 
 
333 aa  311  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  50.45 
 
 
345 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  48.04 
 
 
333 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  48.04 
 
 
333 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  48.04 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  46.53 
 
 
366 aa  309  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  48.24 
 
 
338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  46.75 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  46.8 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  47.53 
 
 
336 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  45.32 
 
 
337 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  47.92 
 
 
334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  45.88 
 
 
339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  45.88 
 
 
339 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  47.08 
 
 
336 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  45.59 
 
 
351 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  47.32 
 
 
334 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  44.38 
 
 
349 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  45.99 
 
 
342 aa  299  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  50.73 
 
 
339 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  47.13 
 
 
336 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  46.9 
 
 
339 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  45.56 
 
 
342 aa  295  6e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  46.63 
 
 
348 aa  295  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.31 
 
 
339 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  46.94 
 
 
334 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  46.63 
 
 
343 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.44 
 
 
348 aa  293  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  44.74 
 
 
336 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  45.88 
 
 
337 aa  289  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  47.95 
 
 
334 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  46.47 
 
 
337 aa  287  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  44.82 
 
 
356 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  46.33 
 
 
334 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  47.66 
 
 
334 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  45.29 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  43.66 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  42.86 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  45.95 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  44.87 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  41.42 
 
 
340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  44.54 
 
 
331 aa  281  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  42.48 
 
 
337 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  43.83 
 
 
359 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  43.49 
 
 
348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  44.57 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  45 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  44.71 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  44.41 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  44.71 
 
 
337 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  44.71 
 
 
337 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  44.71 
 
 
337 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  45.29 
 
 
367 aa  272  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>