261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2168 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  100 
 
 		 349 aa  721    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.93 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  44.38 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  44.38 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  46.06 
 
 		 353 aa  298  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  42.65 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  43.9 
 
 		 344 aa  291  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  42.15 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  42.86 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.05 
 
 		 340 aa  282  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  41.8 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  43.03 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  44.21 
 
 		 344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  41.06 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  43.07 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  44.28 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  41.23 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  43.77 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  42.65 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  44.31 
 
 		 338 aa  265  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  39.17 
 
 		 340 aa  265  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  39.82 
 
 		 343 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  40.06 
 
 		 359 aa  262  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  38.69 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  43.49 
 
 		 343 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  44.94 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.71 
 
 		 352 aa  256  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  36.36 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  46.15 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  41.54 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  40.59 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  43.08 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  38.76 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  43.94 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  41.18 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  40 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  42.94 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.76 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.76 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  39.59 
 
 		 338 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  46.6 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  42.41 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  38.35 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.29 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  38.94 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  41.18 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  38.04 
 
 		 338 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  44.14 
 
 		 349 aa  245  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  39.76 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  40.65 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  43.12 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  43.32 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  41.07 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  38.71 
 
 		 333 aa  242  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.83 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  38.71 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  38.71 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  38.71 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  38.42 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  38.71 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  38.71 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.59 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  40.18 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  38.71 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  38.71 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  40.24 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.41 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  38.01 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  39.94 
 
 		 337 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  40.24 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  40.24 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  40.24 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  41.54 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  39.41 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  40.41 
 
 		 461 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  41.76 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3647  Threonine aldolase  45.57 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  37.83 
 
 		 333 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  38.84 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  39.64 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  40.7 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  40.7 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  40.7 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  40.7 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  37.83 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  37.54 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  40.35 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  37.83 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  40.35 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  42.41 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  40.7 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.41 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  37.83 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  38.87 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  40.12 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  39.14 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  42.14 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  39.29 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>