221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3255 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  100 
 
 		 348 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  90.03 
 
 		 343 aa  597  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  63.72 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  57.31 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  56.85 
 
 		 331 aa  329  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  50.89 
 
 		 348 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  54.78 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  54.68 
 
 		 343 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  46.63 
 
 		 343 aa  295  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  46.63 
 
 		 343 aa  295  6e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.82 
 
 		 344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  45.1 
 
 		 359 aa  278  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  49.7 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  46.5 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  47.08 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  42.86 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  43.37 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  47.94 
 
 		 359 aa  262  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  40.65 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  47.49 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.29 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  43.38 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  45.59 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  42.94 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  45.59 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  47.18 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  45.92 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  45.59 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  45.59 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  40.86 
 
 		 343 aa  248  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  47.73 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  42.73 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  43.92 
 
 		 339 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  47.43 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  45.18 
 
 		 334 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  39.29 
 
 		 343 aa  245  9e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  44.25 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  45.17 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  42.65 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  49.13 
 
 		 367 aa  241  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  43.73 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  44.58 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  41.89 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  47.76 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  43.15 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  43.73 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  43.27 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  42.11 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  40.6 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  42.57 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  42.9 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  42.4 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  47.01 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  46.47 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  44.24 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  46.41 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  43.94 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  43.94 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  43.94 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  43.94 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  43.15 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  40 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  43.64 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  43.64 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  43.64 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  44.25 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.06 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  43.64 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  45.24 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  44.71 
 
 		 333 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  37.57 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  42.18 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  47.6 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.73 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  41.79 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  44.71 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  44.71 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  44.71 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  42.77 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  44.41 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  41.32 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  39.02 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  39.71 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  42.6 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  44.28 
 
 		 334 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  41.81 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  41.81 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  43.41 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  43.31 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  41.52 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  35.96 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  40.54 
 
 		 344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.75 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.58 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.37 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49372  predicted protein  38.46 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  40.92 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  42.37 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  43.75 
 
 		 337 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  43.41 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>