271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2554 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  100 
 
 		 339 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  66.47 
 
 		 340 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  54.88 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  51.23 
 
 		 339 aa  352  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  51.49 
 
 		 344 aa  341  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  49.09 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  45.13 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  40.59 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  43.92 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  42.77 
 
 		 359 aa  265  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.83 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  42.51 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  42.51 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  42.31 
 
 		 343 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  40.29 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  43.34 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  41.98 
 
 		 339 aa  255  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.57 
 
 		 345 aa  255  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  44.54 
 
 		 343 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  42.37 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  44.55 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  43.52 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  41.59 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  42.55 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.12 
 
 		 352 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  42.77 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  40.71 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  43.17 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  44.03 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  42.72 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  42.55 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  40.81 
 
 		 338 aa  238  8e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  41.39 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  41.05 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  38.78 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.94 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  40.68 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  41.67 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  41.96 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  41.95 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  41.41 
 
 		 344 aa  232  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  41.41 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  37.28 
 
 		 343 aa  229  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  41.67 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  42.77 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  43.48 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  41.74 
 
 		 366 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  43.29 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  42.28 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  39.23 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  41.18 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  39.76 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  40.49 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  41.49 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  43.34 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.86 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  43.34 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  42.38 
 
 		 461 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  42.41 
 
 		 337 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  39.88 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  43.34 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  43.34 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  41.61 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  42.68 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  42.68 
 
 		 458 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  42.68 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  42.34 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  42.68 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  42.26 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  41.18 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  42.68 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  42.68 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  42.68 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  42.11 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  42.77 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.39 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  40.73 
 
 		 366 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  41.3 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  41.3 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  41.3 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  41.3 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  41.3 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  42.42 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  42.11 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  40.49 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  41.3 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  41.3 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  42.11 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.27 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  41.93 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  41.3 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  42.59 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  41.8 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  41.27 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  41.57 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  41.93 
 
 		 333 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  41.93 
 
 		 333 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3700  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.82 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.94 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  41.8 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>