245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0380 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  100 
 
 
338 aa  689    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  46.75 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  46.75 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.77 
 
 
345 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  43.18 
 
 
343 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.95 
 
 
344 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  43.36 
 
 
359 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  43.57 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  43.27 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  40.23 
 
 
344 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.87 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  39.59 
 
 
353 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  41.25 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  39.76 
 
 
338 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  41.76 
 
 
357 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  42.43 
 
 
334 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  39.3 
 
 
343 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  41.21 
 
 
337 aa  262  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  39.88 
 
 
341 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  41.74 
 
 
333 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  38.01 
 
 
338 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  38.53 
 
 
339 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  40.53 
 
 
340 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  41.44 
 
 
333 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  37.85 
 
 
340 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  39.3 
 
 
343 aa  256  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  41.44 
 
 
333 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  41.44 
 
 
333 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  38.04 
 
 
349 aa  256  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  41.44 
 
 
333 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  39.23 
 
 
338 aa  255  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  41.14 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  41.14 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  41.44 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  40.84 
 
 
333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  40.59 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  38.89 
 
 
344 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  36.83 
 
 
348 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  37.2 
 
 
331 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  39.88 
 
 
333 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  39.94 
 
 
344 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  39.88 
 
 
333 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  38.71 
 
 
340 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  39.58 
 
 
333 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  38.14 
 
 
345 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  39.58 
 
 
333 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  39.64 
 
 
333 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  41.67 
 
 
348 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  38.17 
 
 
342 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  38.39 
 
 
461 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  39.07 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.41 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  37.76 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  37.87 
 
 
339 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  39.47 
 
 
339 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  38.44 
 
 
343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  40.12 
 
 
366 aa  242  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  37.87 
 
 
339 aa  243  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  37.87 
 
 
351 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  37.57 
 
 
348 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  39.45 
 
 
337 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  38.1 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  38.1 
 
 
458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  38.44 
 
 
337 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  38.44 
 
 
337 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  38.1 
 
 
397 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  38.44 
 
 
337 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  38.44 
 
 
337 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  36.12 
 
 
343 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  39.33 
 
 
333 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.72 
 
 
352 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  39.44 
 
 
337 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  39.13 
 
 
337 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  35.8 
 
 
361 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  37.38 
 
 
343 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  39.1 
 
 
339 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  37.61 
 
 
334 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  39.13 
 
 
337 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  38.21 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  38.82 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  38.82 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  41.43 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  38.51 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  37.35 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  38.42 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  39.29 
 
 
337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  35.03 
 
 
356 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.97 
 
 
339 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  38.87 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  37.61 
 
 
337 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  35.49 
 
 
359 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  38.28 
 
 
337 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  38.99 
 
 
337 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  38.99 
 
 
337 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  35.88 
 
 
348 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  38.1 
 
 
343 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  38.28 
 
 
337 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  38.87 
 
 
337 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  37.98 
 
 
337 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  33.24 
 
 
354 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>