244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6894 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 339 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38080  threonine aldolase  68.07 
 
 		 351 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  50 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.65 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  45.56 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  45.56 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  48.96 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  51.05 
 
 		 340 aa  265  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  48.37 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  47.46 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  45.35 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  47.55 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  44.15 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  47.46 
 
 		 359 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  43.4 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.4 
 
 		 345 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  43.07 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  43.4 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  47.01 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.59 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  46.18 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  40.52 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  46.83 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  49.38 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  48.48 
 
 		 334 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  41.99 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  48.18 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  46.23 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  42.9 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  48.3 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  45.88 
 
 		 349 aa  235  9e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  44.21 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  46.87 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  46.34 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  44.01 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  44.01 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  43.71 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  44.01 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.71 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  42.52 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  43.71 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  44.62 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.71 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  43.71 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  42.94 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  45.07 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  41.94 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.73 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  44.41 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  45.07 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  45.07 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  45.07 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  45 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  46.42 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  45 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  44.67 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  46.11 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  45 
 
 		 458 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  46.11 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  45.79 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  45.79 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  42.86 
 
 		 333 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  45.79 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  42.98 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  42.86 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  42.86 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  42.55 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  38.97 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  42.25 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  37.54 
 
 		 343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  44.54 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  43.33 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  46.76 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  45.17 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  41.03 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  42.01 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  44.55 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  40.73 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  40.73 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  38.87 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  40.73 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  40.73 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  40.91 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  44.38 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  41.03 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  43.66 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  44.21 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  40.43 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  42.81 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  40.43 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  39.82 
 
 		 366 aa  215  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  42.6 
 
 		 348 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  43.34 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  47.37 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.79 
 
 		 360 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  40.43 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  46.89 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  47.04 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.61 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  42.59 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>