256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38080  threonine aldolase  100 
 
 		 351 aa  696    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  68.07 
 
 		 339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  49.4 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  50.15 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  47.18 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  42.4 
 
 		 343 aa  265  8e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  42.4 
 
 		 343 aa  265  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.05 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.45 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  43.82 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.22 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  42.9 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  46.11 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  43.24 
 
 		 344 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  46.11 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  46.11 
 
 		 458 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  45.24 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  44.91 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  43.2 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  48.47 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  46.87 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  46.87 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  46.87 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  46.87 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  40.54 
 
 		 343 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  48.16 
 
 		 337 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  48.16 
 
 		 337 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  47.85 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  48.16 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  42.77 
 
 		 366 aa  235  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  42.9 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  40.88 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  44.01 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  44.01 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  47.55 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  46.13 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  44.01 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  41.72 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  44.34 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  44.35 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  45.78 
 
 		 338 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.95 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  47.62 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  41.89 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  43.71 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  42.32 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  43.49 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.49 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  45.73 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  43.49 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.49 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  39.4 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  46.93 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  44.83 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  43.41 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  42.69 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  46.06 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  44.31 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  41.91 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  44.07 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  44.65 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  43.12 
 
 		 334 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  45.71 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  42.07 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  43.86 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  43.16 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  47.76 
 
 		 339 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  42.51 
 
 		 334 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  42.86 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  43.24 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  41.02 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  44.04 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  42.86 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  47.85 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  45.95 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  42.86 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  42.86 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  42.69 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  40.85 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.15 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  43.07 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  45.29 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.96 
 
 		 360 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5390  putative L-allo-threonine aldolase  43.62 
 
 		 355 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.891866  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  43.94 
 
 		 353 aa  216  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  35.21 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  40.67 
 
 		 333 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  40.67 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  40.67 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  40.67 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  44.88 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  40.98 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  43.16 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  40.37 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  40.37 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  40.67 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  40.67 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  43.36 
 
 		 335 aa  212  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  46.93 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  41.06 
 
 		 348 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>