269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5390 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5390  putative L-allo-threonine aldolase  100 
 
 		 355 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.891866  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  75.77 
 
 		 360 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3700  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  79.44 
 
 		 355 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1764  threonine aldolase  77.05 
 
 		 388 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382651  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  70.54 
 
 		 371 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  65.25 
 
 		 366 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.05 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  48.24 
 
 		 343 aa  325  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50 
 
 		 347 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.15 
 
 		 347 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50 
 
 		 348 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0618  L-allo-threonine aldolase, putative  41.11 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164351  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  45.37 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  45.37 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.18 
 
 		 340 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  45.95 
 
 		 461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  45.35 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  45.35 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  41.3 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  41.3 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  45.35 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  45.35 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  45.35 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  45.35 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  45.35 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  44.74 
 
 		 337 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  45.05 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.58 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  44.44 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  44.44 
 
 		 337 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  44.78 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  44.14 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  41.69 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  44.38 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  40.35 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  39.94 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  41.69 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  42.98 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  42.34 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  38.76 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  43.43 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  46.2 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  42.47 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  45.21 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  43.03 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  38.62 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  43.03 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  44.01 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.64 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  43.03 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  42.23 
 
 		 339 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  38.76 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  39.27 
 
 		 355 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  43.96 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  41.94 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  42.86 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  37.04 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  44.15 
 
 		 339 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  38.82 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  38.39 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  43.45 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  39.94 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  43.38 
 
 		 339 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.99 
 
 		 348 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  38.48 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  41.21 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  38.44 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  41.44 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  41.44 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  41.44 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  41.14 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  38.92 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  39.51 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  38.53 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  40.84 
 
 		 337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  40.84 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38080  threonine aldolase  44.01 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  39.47 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  40.29 
 
 		 338 aa  212  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.74 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  39.47 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  42.55 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  39.47 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  39.17 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  39.47 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  39.82 
 
 		 339 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  40.23 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  39.82 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  39.88 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  37.35 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  39.94 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  40.76 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  39.82 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  40.76 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  40.76 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  36.01 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  37.96 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  41.14 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  39.94 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>