More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1764 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1764  threonine aldolase  100 
 
 		 388 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382651  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3700  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  88.7 
 
 		 355 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  82.15 
 
 		 360 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5390  putative L-allo-threonine aldolase  77.05 
 
 		 355 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.891866  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  71.67 
 
 		 371 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  66.29 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.79 
 
 		 352 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  50.59 
 
 		 343 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.19 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.89 
 
 		 347 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.08 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.04 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0618  L-allo-threonine aldolase, putative  42.27 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164351  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  47.06 
 
 		 461 aa  265  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.94 
 
 		 340 aa  265  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  45.88 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  45.88 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  45.88 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  45.88 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  45.88 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  45.88 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  45.88 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  42.82 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  45.19 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  45.16 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  45.16 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  46.31 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  45.51 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  45.21 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  44.54 
 
 		 359 aa  248  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  39.53 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  39.53 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  45.21 
 
 		 337 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  45.21 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  43.84 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  44.91 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  47.06 
 
 		 343 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  38.1 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  43.98 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.95 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  40.96 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  41.95 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  45.05 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  42.73 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  42.4 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  41.58 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  45.77 
 
 		 339 aa  237  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  43.44 
 
 		 333 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  42.86 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  45.54 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  39.12 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  43.15 
 
 		 333 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  43.15 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  43.15 
 
 		 333 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  41.34 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  42.73 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  43.5 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  39.65 
 
 		 344 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  42.73 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  45.54 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  43.54 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  42.74 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  43.6 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  41.84 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.73 
 
 		 339 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  42.52 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  42.52 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  42.52 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  42.52 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  37.42 
 
 		 340 aa  229  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  41.28 
 
 		 344 aa  229  8e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  42.73 
 
 		 352 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  42.52 
 
 		 333 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  42.52 
 
 		 333 aa  229  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  42.52 
 
 		 333 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  42.23 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  41.76 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  43.31 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  42.52 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  44.94 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  45.54 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  41.18 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  40.88 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  40.94 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  40 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  38.17 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  40.22 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  41.18 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  44.19 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  42.98 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  36.53 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  41.12 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  41.18 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  42.23 
 
 		 337 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  40.83 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  42.18 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  41.18 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  39.7 
 
 		 343 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  44.05 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  35.5 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>