293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4745 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  100 
 
 
339 aa  699    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  64.67 
 
 
343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  52.73 
 
 
340 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  52.45 
 
 
340 aa  363  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  50 
 
 
344 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  51.23 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  49.7 
 
 
343 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  45.05 
 
 
343 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  42.86 
 
 
349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  47.22 
 
 
359 aa  278  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  43.98 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.17 
 
 
340 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  43.45 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  48.78 
 
 
345 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  42.86 
 
 
343 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  42.86 
 
 
343 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.92 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.73 
 
 
345 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  44.17 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  44.28 
 
 
344 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  45.57 
 
 
338 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  42.77 
 
 
341 aa  262  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.75 
 
 
348 aa  261  8.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  49.81 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  42.86 
 
 
344 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  45.15 
 
 
337 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  45.99 
 
 
334 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  43.12 
 
 
342 aa  256  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  45.45 
 
 
337 aa  255  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  41.86 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  44.41 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  44.1 
 
 
355 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  42.15 
 
 
334 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  45.15 
 
 
337 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  42.68 
 
 
343 aa  253  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  44.55 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  44.55 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  44.55 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  44.55 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  44.55 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  44.55 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  44.55 
 
 
333 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  44.14 
 
 
337 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  45.68 
 
 
334 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  43.5 
 
 
353 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  45.15 
 
 
337 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  43.38 
 
 
348 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  45.15 
 
 
333 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  43.69 
 
 
343 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  44.55 
 
 
333 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  42.52 
 
 
356 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  43.83 
 
 
331 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  44.94 
 
 
333 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  42.61 
 
 
343 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  44.94 
 
 
333 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  44.94 
 
 
333 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  44.94 
 
 
333 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  46.5 
 
 
334 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  43.83 
 
 
337 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  43.87 
 
 
337 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  44.64 
 
 
333 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  43.95 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  45.76 
 
 
461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  44.82 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  43.84 
 
 
336 aa  245  9e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  41.96 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  44.31 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  41.95 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  44.55 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  43.37 
 
 
338 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  45.45 
 
 
339 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  44.55 
 
 
337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  44.55 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  44.55 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  44.55 
 
 
337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  44.55 
 
 
397 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  43.94 
 
 
337 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  45.34 
 
 
359 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  43.03 
 
 
337 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  40.48 
 
 
348 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.03 
 
 
337 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.03 
 
 
337 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  44.55 
 
 
397 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  43.03 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  44.55 
 
 
458 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  43.86 
 
 
354 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  41.41 
 
 
344 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  42.57 
 
 
338 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  43.64 
 
 
337 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.01 
 
 
347 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  43.64 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.27 
 
 
347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  39.18 
 
 
338 aa  235  8e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  43.15 
 
 
337 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  43.15 
 
 
337 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  41.57 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  43.5 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  43.2 
 
 
351 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  40.3 
 
 
366 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  43.2 
 
 
339 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>