240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3444 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  100 
 
 
359 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.72 
 
 
344 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  46.04 
 
 
359 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  49.69 
 
 
353 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  49.85 
 
 
334 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  43.82 
 
 
341 aa  291  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  49.56 
 
 
334 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  46.5 
 
 
344 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  47.22 
 
 
339 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.12 
 
 
345 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  48.4 
 
 
343 aa  279  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  45.22 
 
 
344 aa  278  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  44.21 
 
 
340 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  49.7 
 
 
337 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  49.7 
 
 
337 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  43.83 
 
 
343 aa  277  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  43.83 
 
 
343 aa  277  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  51.02 
 
 
343 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  47.09 
 
 
357 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  49.39 
 
 
337 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  46.75 
 
 
337 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  49.09 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  46.45 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  46.45 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  42.32 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  48.77 
 
 
336 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  46.45 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  49.13 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  44.83 
 
 
366 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  46.2 
 
 
337 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  49.55 
 
 
343 aa  268  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  48.02 
 
 
334 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  46.65 
 
 
334 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  47.02 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  46.48 
 
 
348 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  47.94 
 
 
348 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  48.25 
 
 
334 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  44.41 
 
 
344 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  45.02 
 
 
337 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  47.56 
 
 
337 aa  265  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  46.92 
 
 
338 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  47.06 
 
 
339 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  48.22 
 
 
359 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  43.44 
 
 
344 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  47.06 
 
 
339 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.83 
 
 
340 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  49.55 
 
 
339 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  40.06 
 
 
349 aa  262  6e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  43.03 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  45.67 
 
 
338 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  47.08 
 
 
338 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  47.49 
 
 
355 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  46.79 
 
 
342 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  46.81 
 
 
333 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  44.71 
 
 
333 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  48.22 
 
 
345 aa  256  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  46.67 
 
 
333 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.15 
 
 
347 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  44.95 
 
 
337 aa  256  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  42.31 
 
 
353 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  48.09 
 
 
331 aa  255  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  46.5 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  46.5 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  46.5 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  46.5 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  43.47 
 
 
343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  46.2 
 
 
333 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  47.4 
 
 
336 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  46.67 
 
 
333 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  46.2 
 
 
333 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  45.16 
 
 
461 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  44.97 
 
 
337 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  49.12 
 
 
334 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  45.87 
 
 
333 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  47.23 
 
 
339 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  45.21 
 
 
333 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  45.99 
 
 
339 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  48.53 
 
 
334 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  46.18 
 
 
337 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  44.91 
 
 
333 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  45.91 
 
 
335 aa  249  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  47.53 
 
 
338 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  45.87 
 
 
333 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  45.87 
 
 
333 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  40.18 
 
 
343 aa  249  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  47.11 
 
 
337 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  47.11 
 
 
337 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  45.88 
 
 
337 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  46.65 
 
 
336 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  44.77 
 
 
397 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  47.11 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  45.59 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.69 
 
 
347 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  44.77 
 
 
397 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  44.77 
 
 
458 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  45.65 
 
 
339 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  44.74 
 
 
337 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  44.74 
 
 
337 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  44.74 
 
 
337 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  44.74 
 
 
337 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>