263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0218 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  92.11 
 
 
344 aa  646    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  100 
 
 
344 aa  707    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  55.82 
 
 
359 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  54.2 
 
 
353 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  50.6 
 
 
343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  50.6 
 
 
343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  54.03 
 
 
357 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  47.81 
 
 
353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  50.6 
 
 
343 aa  317  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.38 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  48.82 
 
 
344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  49.24 
 
 
344 aa  308  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.85 
 
 
344 aa  305  7e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  47.41 
 
 
348 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  48.4 
 
 
339 aa  298  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  47.75 
 
 
341 aa  298  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  45.97 
 
 
343 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  45.88 
 
 
334 aa  295  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.1 
 
 
339 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  49.85 
 
 
348 aa  292  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  49.12 
 
 
340 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  46.71 
 
 
337 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  51.96 
 
 
339 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  49.85 
 
 
338 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  45.02 
 
 
366 aa  288  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  48.04 
 
 
336 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  46.41 
 
 
337 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  48.94 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  47.09 
 
 
334 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  47.63 
 
 
339 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  45.27 
 
 
334 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  46.71 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  46.71 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  47.65 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  46.31 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  46.41 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  46.41 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  46.41 
 
 
337 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  46.25 
 
 
337 aa  279  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  46.11 
 
 
337 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  46.2 
 
 
334 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  43.86 
 
 
337 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  45.91 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  44.21 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  46.2 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  46.55 
 
 
367 aa  272  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  45.29 
 
 
338 aa  271  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  43.54 
 
 
343 aa  268  8e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  47.65 
 
 
337 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  43.23 
 
 
356 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  46.63 
 
 
461 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  46.7 
 
 
355 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  44.55 
 
 
338 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  46.87 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  47.51 
 
 
397 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  47.65 
 
 
337 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  47.65 
 
 
337 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  44.74 
 
 
356 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  47.65 
 
 
337 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  44.74 
 
 
386 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  48.53 
 
 
339 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  44.21 
 
 
359 aa  264  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  47.65 
 
 
337 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  47.49 
 
 
397 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  44.74 
 
 
386 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  47.37 
 
 
458 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  47.06 
 
 
337 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  43.94 
 
 
337 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  47.63 
 
 
337 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  45.43 
 
 
336 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  47.63 
 
 
337 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  43.9 
 
 
340 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  43.44 
 
 
359 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  47.25 
 
 
343 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  44.24 
 
 
337 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  47.06 
 
 
337 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  47.75 
 
 
337 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  46.76 
 
 
337 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  48.87 
 
 
333 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  45.22 
 
 
334 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  45.22 
 
 
334 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  48.87 
 
 
333 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  48.87 
 
 
333 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  48.87 
 
 
333 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  48.87 
 
 
333 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  42.86 
 
 
370 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  43.68 
 
 
354 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  44.91 
 
 
352 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  46.55 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  48.82 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  41.37 
 
 
343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  43.64 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  47.37 
 
 
335 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  45.64 
 
 
345 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  43.64 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  49.07 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  45.45 
 
 
352 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  48.05 
 
 
335 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.37 
 
 
348 aa  251  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  42.9 
 
 
342 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>