252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2159 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  100 
 
 		 386 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  100 
 
 		 356 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  100 
 
 		 386 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  57.39 
 
 		 352 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  54.49 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  54.35 
 
 		 359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  51.07 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  50.58 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  48.97 
 
 		 353 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  47.59 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  43.35 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  43.35 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  44.19 
 
 		 353 aa  279  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.31 
 
 		 345 aa  278  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  49.55 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  46.46 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  44.41 
 
 		 334 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  45.29 
 
 		 344 aa  268  8e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  44.19 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  47.79 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  42.94 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  46.29 
 
 		 336 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  42.82 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  49.13 
 
 		 338 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  47.63 
 
 		 461 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  44.61 
 
 		 337 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  43.24 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  41.12 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.35 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  51.55 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  43.24 
 
 		 333 aa  259  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  47.34 
 
 		 397 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  47.34 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  47.34 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  47.34 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  47.34 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  47.34 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  47.34 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  43.53 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  44.41 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  43.71 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  43.53 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  44.41 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  44.41 
 
 		 333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  44.12 
 
 		 333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  44.41 
 
 		 333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  47.39 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  49.83 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  43.24 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  45.83 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  46.59 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  46.75 
 
 		 337 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  46.75 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  44.72 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  48.23 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  48.23 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  43.36 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  43.66 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.54 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  40.64 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  47.59 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  45.86 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  42.9 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  40.88 
 
 		 333 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  41.74 
 
 		 359 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  45.86 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  45.4 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  45.82 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  40.59 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  40.59 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  40.59 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  47.51 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  40.59 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  45.36 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  40.29 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  42.94 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  45.83 
 
 		 345 aa  242  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  40.29 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  40.29 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  43.07 
 
 		 337 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  43.07 
 
 		 337 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  46.36 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  43.49 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  46.92 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  44.28 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  44.87 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  45.82 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  46.65 
 
 		 339 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  43.79 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  45.21 
 
 		 334 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  41.78 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2144  threonine aldolase  44.07 
 
 		 344 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.708281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  47.91 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  41.99 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  41.93 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  40.79 
 
 		 368 aa  229  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  42.99 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  43.79 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  45.56 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>