255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1448 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  100 
 
 
339 aa  678    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  96.17 
 
 
339 aa  617  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  62.95 
 
 
337 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  63.25 
 
 
337 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  62.95 
 
 
337 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  62.65 
 
 
337 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  63.44 
 
 
337 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  62.95 
 
 
337 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  63.44 
 
 
337 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  60.54 
 
 
334 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  59.82 
 
 
461 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  59.94 
 
 
337 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  59.82 
 
 
397 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  59.94 
 
 
337 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  60.24 
 
 
337 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  60.24 
 
 
337 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  59.52 
 
 
397 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  59.52 
 
 
458 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  60.54 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  60.24 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  59.05 
 
 
334 aa  351  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  59.05 
 
 
334 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  57.93 
 
 
334 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  56.61 
 
 
355 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  56.1 
 
 
337 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  57.01 
 
 
336 aa  334  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  57.28 
 
 
337 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  56.76 
 
 
348 aa  332  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  57.53 
 
 
334 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  51.04 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  55.18 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  53.77 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  55.86 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  52.27 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  53.14 
 
 
334 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  56.92 
 
 
336 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  55.02 
 
 
337 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  58.58 
 
 
339 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  53.43 
 
 
337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  57.23 
 
 
335 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  55.03 
 
 
343 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  55.02 
 
 
337 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  53.14 
 
 
334 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  50.44 
 
 
337 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  53.43 
 
 
337 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  53.43 
 
 
337 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  53.73 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  57.61 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  53.43 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  56.43 
 
 
336 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  57.31 
 
 
334 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  54.93 
 
 
342 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  51.2 
 
 
333 aa  316  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  51.81 
 
 
333 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  52.11 
 
 
333 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  51.2 
 
 
333 aa  316  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  50.9 
 
 
333 aa  315  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  50.9 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  50.9 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  50.9 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  51.81 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  51.81 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  49.56 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  50.6 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  50.6 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  55.04 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  51.51 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  50.3 
 
 
333 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  50.68 
 
 
370 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  53.89 
 
 
367 aa  308  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  49.55 
 
 
333 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  55.56 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  51.81 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.51 
 
 
339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  50.15 
 
 
351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  50.3 
 
 
339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  50 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  51.34 
 
 
354 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  50.58 
 
 
357 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2144  threonine aldolase  53.44 
 
 
344 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.708281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  52.05 
 
 
359 aa  292  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3651  threonine aldolase  56.4 
 
 
349 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2851  L-threonine aldolase  53.75 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  48.54 
 
 
344 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  52.1 
 
 
353 aa  275  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  48.53 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  53.5 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  44.67 
 
 
343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  44.67 
 
 
343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  47.23 
 
 
359 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  46.89 
 
 
344 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.24 
 
 
344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  44.44 
 
 
344 aa  252  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  43.43 
 
 
353 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  43.58 
 
 
343 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  43.93 
 
 
340 aa  249  6e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  44.65 
 
 
339 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  46.89 
 
 
348 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  43.03 
 
 
341 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45 
 
 
360 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>