256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3647 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3647  Threonine aldolase  100 
 
 		 334 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  51.02 
 
 		 340 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.89 
 
 		 344 aa  252  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  43.58 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  43.58 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  45.57 
 
 		 349 aa  245  8e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  43.32 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  43.32 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  42.2 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  42.38 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  46.83 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  46.02 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  41.46 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  43.32 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  45.99 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  42.51 
 
 		 338 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.37 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  48.18 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  47.09 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  50.61 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.04 
 
 		 345 aa  232  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  49.54 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  40.79 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  42.02 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  39.88 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  42.47 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  46.18 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  40.82 
 
 		 359 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  42.63 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  49.65 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  41.82 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  42.63 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  45.71 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  42.63 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  42.63 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  42.33 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  42.32 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  50.52 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  42.06 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  44.92 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  47.69 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  42.33 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  38.53 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  41.9 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  41.16 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  42.77 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  45.71 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  42.77 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  44 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  44.48 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  42.77 
 
 		 458 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  45.74 
 
 		 337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  44.62 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  43.16 
 
 		 367 aa  222  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  41.35 
 
 		 344 aa  222  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  42.64 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  44.31 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  44.31 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  39.64 
 
 		 341 aa  221  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  46.69 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  43.69 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  46.39 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  40.37 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  43.73 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  40.37 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  40.37 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  42.77 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  40.37 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  40.37 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  41.12 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  40.37 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  45.36 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  40.37 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  41.77 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  40.06 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  40.06 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  44.48 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  41.46 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  41.36 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  41.57 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  41.44 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2144  threonine aldolase  45.59 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.708281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  41.46 
 
 		 339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  47.39 
 
 		 343 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  41.59 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  45.18 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  41.41 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  47.59 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  38.58 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  43.29 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  37.69 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  40.12 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38080  threonine aldolase  43.03 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>