253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0009 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 352 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2069  L-threonine aldolase  59.12 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5453  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.01 
 
 		 364 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  54.49 
 
 		 351 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  41.94 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  41.52 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  41.3 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  41.3 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  44.02 
 
 		 344 aa  252  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  44.9 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  45.67 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.88 
 
 		 345 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.51 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  43.57 
 
 		 344 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  44.01 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  39.23 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  42.34 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  41.94 
 
 		 353 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  45.13 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  38.82 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  44.38 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  45.06 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  43.75 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  44.64 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  44.41 
 
 		 340 aa  232  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  43.88 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  41.4 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  42.9 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  41.69 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.11 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  44.12 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  41.12 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  40.83 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.26 
 
 		 352 aa  222  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  40.88 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  42.54 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  40.53 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  42.69 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  40.83 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  38.73 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  38.15 
 
 		 334 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  40.59 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  44.08 
 
 		 339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  42.98 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  42.73 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  43.23 
 
 		 355 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  42.73 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  42.44 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  38.78 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  43.15 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  39.65 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  45.86 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  39.94 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  39.94 
 
 		 337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  39.94 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  42.73 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  40.92 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.43 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  38.78 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  44.21 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  42.16 
 
 		 370 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  40.82 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  42.77 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  41.32 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  39.36 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.33 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  39.64 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2144  threonine aldolase  44.12 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.708281 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  39.82 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  41.11 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  39.82 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  39.82 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  39.82 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  38.37 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  39.82 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  39.82 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  45.7 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  32.94 
 
 		 338 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49372  predicted protein  39.26 
 
 		 400 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  39.41 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  39.82 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  41.02 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  39.35 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  39.23 
 
 		 461 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  39.41 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  44.81 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  40.52 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  37.2 
 
 		 349 aa  202  8e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  40.42 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  41.02 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  38.73 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  38.01 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  36.73 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  40.72 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  40.3 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  36.89 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  37.13 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  40.34 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  40.68 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  40.18 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>