184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2069 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2069  L-threonine aldolase  100 
 
 		 379 aa  756    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  59.12 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5453  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  53.8 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.84 
 
 		 351 aa  299  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  43.03 
 
 		 343 aa  262  6e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  41.04 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  41.04 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  40.52 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.07 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  44.48 
 
 		 340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.15 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  42.52 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  41.09 
 
 		 344 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  42.11 
 
 		 337 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  42.21 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  44.01 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  42.51 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  40.29 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  42.3 
 
 		 344 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  37.06 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  40.82 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  41.77 
 
 		 339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  41.3 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  38.01 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  43.15 
 
 		 339 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  42.06 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  43.11 
 
 		 334 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  40.41 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  34.51 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  43.81 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  41.94 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  38.66 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  42.39 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  45.02 
 
 		 343 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  42.6 
 
 		 334 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  43.03 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  40.41 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  37.36 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  36.55 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  40.06 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  35.29 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  39.23 
 
 		 337 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  43.27 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  40.17 
 
 		 343 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  40.29 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  37.8 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  41.89 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  36.71 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  40.29 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  39.76 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  40.29 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  39.12 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  40.74 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  38.84 
 
 		 348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  40.17 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  40.17 
 
 		 339 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  40.17 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  40 
 
 		 345 aa  199  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  38.94 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  42.69 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  41.21 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2144  threonine aldolase  40.52 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.708281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  42.52 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  36.28 
 
 		 339 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.73 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49372  predicted protein  36.29 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  36.7 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.98 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  38.94 
 
 		 337 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  42.52 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  39.77 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.82 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  35.65 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  33.85 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  44.04 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  38.78 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  41.59 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  38.78 
 
 		 333 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  38.78 
 
 		 333 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  38.48 
 
 		 333 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  38.48 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  41.13 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  37.03 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  35.82 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  38.05 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3647  Threonine aldolase  45.3 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  37.32 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  37.61 
 
 		 333 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  38.83 
 
 		 361 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  37.32 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  37.32 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  37.32 
 
 		 333 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  37.1 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  37.32 
 
 		 333 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  37.32 
 
 		 333 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  37.32 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  39.41 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  38.38 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2851  L-threonine aldolase  43.1 
 
 		 343 aa  186  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.03 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>