219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5453 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5453  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 364 aa  722    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.01 
 
 		 352 aa  348  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2069  L-threonine aldolase  53.8 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.4 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  40.52 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  38.9 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  38.9 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.24 
 
 		 345 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  41.74 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.28 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  43.54 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3043  Threonine aldolase  42.48 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  40.83 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  43.37 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  42.82 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  43.93 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  42.98 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  39.88 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  38.62 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  44.71 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  37.23 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  42.81 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  45.38 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  43.79 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  42.43 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  42.9 
 
 		 339 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.6 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  42.77 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  43.37 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  42.18 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  38.51 
 
 		 359 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  40.47 
 
 		 337 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  40.18 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  40.68 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  43.07 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  40.29 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  41.71 
 
 		 361 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  43.93 
 
 		 334 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  40.68 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  40.68 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  40.68 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  41.28 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  42.06 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  40.68 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  42.14 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  40.48 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  39.46 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  41.43 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  40.66 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  37.54 
 
 		 349 aa  206  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  37.87 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  38.82 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  41.79 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  43.93 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  38.82 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  41.85 
 
 		 338 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  38.82 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  38.82 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  38.82 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  42.56 
 
 		 343 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  36.31 
 
 		 340 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  38.51 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  38.51 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  42.49 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  41.05 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  40.55 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  39.3 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  39.82 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  40.55 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6894  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.47 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  37.31 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  38.97 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  34.57 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2144  threonine aldolase  42.99 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.708281 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  37.17 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  37.58 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  37.21 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  41.95 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  37.94 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  40.7 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  37.17 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.12 
 
 		 348 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  38.91 
 
 		 348 aa  196  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  37.17 
 
 		 337 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  39.02 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  39.02 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  38.84 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  40 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  38.39 
 
 		 337 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  38.39 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  38.39 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  40.18 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  37.04 
 
 		 340 aa  192  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  36.87 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  36.44 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  41.3 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  41.86 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  39.89 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  37.35 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>