More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3702 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3702  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
575 aa  1167    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0856  DNA mismatch repair protein  52.52 
 
 
563 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0504  DNA mismatch repair protein  49.59 
 
 
587 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768235  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  53.11 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  52.71 
 
 
561 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  52.54 
 
 
561 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  52.17 
 
 
565 aa  596  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1780  DNA mismatch repair protein  47.5 
 
 
541 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.644143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  28.57 
 
 
603 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  29.53 
 
 
559 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  29.82 
 
 
586 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  30.28 
 
 
585 aa  223  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  28.3 
 
 
647 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  31.34 
 
 
605 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  30.25 
 
 
599 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  31.7 
 
 
605 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  33.45 
 
 
540 aa  217  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  29.89 
 
 
588 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  31.69 
 
 
611 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  29.84 
 
 
612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  29.05 
 
 
603 aa  213  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  31.16 
 
 
620 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  29.64 
 
 
612 aa  211  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  31.02 
 
 
575 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  33.17 
 
 
544 aa  210  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 
574 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  31.41 
 
 
532 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  30.15 
 
 
557 aa  207  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  31.24 
 
 
632 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  27.83 
 
 
606 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  26.98 
 
 
622 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  29.3 
 
 
566 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  29.64 
 
 
621 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  28.96 
 
 
632 aa  200  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  30.08 
 
 
608 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  28.7 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  30.61 
 
 
616 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  29.58 
 
 
602 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  30.43 
 
 
603 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  29.17 
 
 
589 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  31.88 
 
 
621 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  30.87 
 
 
582 aa  195  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  28.85 
 
 
635 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  30.37 
 
 
549 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  30.33 
 
 
612 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  27.36 
 
 
608 aa  194  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  30.34 
 
 
610 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  29.07 
 
 
566 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  27.34 
 
 
588 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  29.29 
 
 
560 aa  194  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  28.9 
 
 
566 aa  193  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 
606 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  28.59 
 
 
595 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  30.02 
 
 
601 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  29.91 
 
 
621 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  29.76 
 
 
594 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  29.84 
 
 
595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  27.36 
 
 
602 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  29.85 
 
 
619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  29.84 
 
 
595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  27.08 
 
 
628 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  29.38 
 
 
597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  28.1 
 
 
516 aa  191  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  29.71 
 
 
633 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  28.35 
 
 
603 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  28.64 
 
 
626 aa  190  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  28.71 
 
 
622 aa  190  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  27.98 
 
 
572 aa  190  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  29.13 
 
 
599 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  29.71 
 
 
633 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  30.22 
 
 
635 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  27.11 
 
 
617 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  29.57 
 
 
565 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  29.28 
 
 
623 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  27.87 
 
 
600 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  27.72 
 
 
630 aa  187  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  30.4 
 
 
604 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 
611 aa  187  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  27.79 
 
 
605 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  28.94 
 
 
613 aa  186  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  26.42 
 
 
608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  28.85 
 
 
636 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  27.34 
 
 
600 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  29.5 
 
 
625 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  27.59 
 
 
605 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  29.26 
 
 
603 aa  183  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  29.62 
 
 
582 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  29.81 
 
 
607 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  28.91 
 
 
597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  28.86 
 
 
615 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  25.42 
 
 
623 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  28.57 
 
 
644 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  28.37 
 
 
611 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  27.74 
 
 
616 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  30.27 
 
 
579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  25.26 
 
 
626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  26.17 
 
 
630 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  25.88 
 
 
551 aa  173  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  28.22 
 
 
660 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  23.99 
 
 
589 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>