More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1780 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1780  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 541 aa  1078    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.644143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0856  DNA mismatch repair protein  50 
 
 		 563 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  50.18 
 
 		 565 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  50.36 
 
 		 561 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  50.36 
 
 		 561 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  48.67 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0504  DNA mismatch repair protein  45.97 
 
 		 587 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768235  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3702  DNA mismatch repair protein  47.5 
 
 		 575 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  28.9 
 
 		 559 aa  207  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  33.95 
 
 		 540 aa  206  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  29.37 
 
 		 585 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 		 565 aa  200  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  28.72 
 
 		 586 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  28.55 
 
 		 632 aa  200  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  27.91 
 
 		 612 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  28.55 
 
 		 622 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  27.74 
 
 		 597 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  32.49 
 
 		 544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  27.98 
 
 		 595 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  27.73 
 
 		 602 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  27.86 
 
 		 599 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  28.93 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  29.01 
 
 		 574 aa  190  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  29.82 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  29.07 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  30.86 
 
 		 601 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  28.6 
 
 		 605 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  27.6 
 
 		 600 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  29.67 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  30.77 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  28.43 
 
 		 612 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  28.22 
 
 		 605 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  29.74 
 
 		 632 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  26.13 
 
 		 572 aa  183  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  29.4 
 
 		 594 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  29.58 
 
 		 616 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  27.54 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  30 
 
 		 560 aa  181  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  27.37 
 
 		 566 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  30.1 
 
 		 620 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  29.78 
 
 		 582 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  26.84 
 
 		 647 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 		 600 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  26.78 
 
 		 566 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  25.62 
 
 		 605 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  29.22 
 
 		 611 aa  177  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  28.43 
 
 		 608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  28.33 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  31.48 
 
 		 549 aa  174  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2227  MutL dimerisation  28.85 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000451621  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  27.95 
 
 		 516 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  23.14 
 
 		 589 aa  170  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  26.37 
 
 		 557 aa  170  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  27.21 
 
 		 610 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  26.59 
 
 		 589 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  27.38 
 
 		 588 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  28.93 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  29.51 
 
 		 582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  28.93 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 		 608 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  34.36 
 
 		 620 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  23.71 
 
 		 603 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  29.79 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  27.14 
 
 		 644 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  28.2 
 
 		 621 aa  153  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  32.49 
 
 		 615 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  29.63 
 
 		 608 aa  150  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  30.65 
 
 		 650 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  29.84 
 
 		 583 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  36.88 
 
 		 687 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  36.88 
 
 		 688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  32.02 
 
 		 606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  30.65 
 
 		 647 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  26.43 
 
 		 584 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 765 aa  148  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  31.28 
 
 		 617 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  32.19 
 
 		 738 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  35.13 
 
 		 661 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  24.2 
 
 		 551 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 667 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 667 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 667 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  32.84 
 
 		 634 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  25.89 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  27.06 
 
 		 598 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 		 623 aa  144  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  35.85 
 
 		 652 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 		 623 aa  144  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  35.45 
 
 		 621 aa  144  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.43 
 
 		 625 aa  143  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 		 662 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  30.54 
 
 		 640 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 		 603 aa  143  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  29.76 
 
 		 692 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  28.27 
 
 		 682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  31.91 
 
 		 599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  35.76 
 
 		 641 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 		 681 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>