More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0856 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0856  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
563 aa  1160    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  62.37 
 
 
561 aa  722    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0504  DNA mismatch repair protein  58.26 
 
 
587 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768235  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  60.25 
 
 
566 aa  703    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  62.37 
 
 
561 aa  722    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  75.27 
 
 
565 aa  882    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3702  DNA mismatch repair protein  52.52 
 
 
575 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1780  DNA mismatch repair protein  50 
 
 
541 aa  549  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.644143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  29.04 
 
 
559 aa  256  6e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  30.28 
 
 
532 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  28.66 
 
 
586 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  29.49 
 
 
585 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  27.38 
 
 
606 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  30.21 
 
 
594 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  29.38 
 
 
605 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  25.56 
 
 
614 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  27.94 
 
 
599 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  30.88 
 
 
610 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  28.92 
 
 
599 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  25.89 
 
 
602 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  27.7 
 
 
603 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  28.26 
 
 
566 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  28.35 
 
 
566 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  28.38 
 
 
566 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  26.39 
 
 
622 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  28.24 
 
 
595 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  29.34 
 
 
611 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  27.39 
 
 
623 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  27.39 
 
 
623 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  28.69 
 
 
597 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  27.71 
 
 
602 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  28.85 
 
 
603 aa  210  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  32.35 
 
 
549 aa  209  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  29.49 
 
 
616 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  28.25 
 
 
557 aa  209  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  27.21 
 
 
588 aa  209  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  29.34 
 
 
612 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  29.03 
 
 
632 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  28.62 
 
 
600 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  27.66 
 
 
565 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  27.63 
 
 
603 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  28.43 
 
 
603 aa  206  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  28.96 
 
 
608 aa  206  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  27.17 
 
 
617 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  29.13 
 
 
644 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  29.59 
 
 
605 aa  202  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  28.69 
 
 
560 aa  202  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  27.1 
 
 
620 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  28.06 
 
 
600 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  26.72 
 
 
597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  27.69 
 
 
588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  27.59 
 
 
615 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  30.62 
 
 
540 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  26.63 
 
 
610 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  28.71 
 
 
605 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  25.87 
 
 
619 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  28.66 
 
 
621 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  28.43 
 
 
622 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  28.59 
 
 
606 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  27.5 
 
 
635 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  27.29 
 
 
605 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  27.92 
 
 
575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  27.92 
 
 
574 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  27.98 
 
 
612 aa  197  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  27.78 
 
 
635 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  29.02 
 
 
604 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  26.09 
 
 
623 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  25.7 
 
 
589 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  25.7 
 
 
589 aa  194  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  28.79 
 
 
582 aa  194  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  26.87 
 
 
613 aa  193  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  30.14 
 
 
544 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  27.61 
 
 
611 aa  192  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  26.27 
 
 
611 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  26.86 
 
 
616 aa  191  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  27.18 
 
 
603 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  28.55 
 
 
621 aa  190  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  27.62 
 
 
633 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2227  MutL dimerisation  27.38 
 
 
584 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000451621  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  27.51 
 
 
605 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  30 
 
 
595 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  28.1 
 
 
598 aa  188  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  27.2 
 
 
632 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  30 
 
 
595 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  27.36 
 
 
632 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  27.2 
 
 
601 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  26.89 
 
 
633 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0226  DNA mismatch repair protein MutL  25.76 
 
 
608 aa  186  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  25.32 
 
 
608 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  27.34 
 
 
612 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  25.42 
 
 
572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  27.02 
 
 
623 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  28.28 
 
 
579 aa  183  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  27.32 
 
 
617 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  23.71 
 
 
606 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  25.62 
 
 
630 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  26.48 
 
 
630 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  27.29 
 
 
660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  23.97 
 
 
611 aa  181  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  27.21 
 
 
516 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>