More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1136 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  81.37 
 
 		 467 aa  803    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 472 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  70.15 
 
 		 471 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  69.81 
 
 		 469 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  69.3 
 
 		 469 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  83.94 
 
 		 467 aa  826    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  74.03 
 
 		 472 aa  703    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  74.95 
 
 		 472 aa  735    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  67.31 
 
 		 468 aa  693    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  66.16 
 
 		 474 aa  652    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  68.23 
 
 		 469 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  82.44 
 
 		 468 aa  793    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  82.44 
 
 		 468 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  67.38 
 
 		 469 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  68.31 
 
 		 467 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  82.66 
 
 		 467 aa  811    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.1 
 
 		 474 aa  665    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 468 aa  968    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  70.56 
 
 		 468 aa  663    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  73.66 
 
 		 478 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  82.44 
 
 		 468 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  62.31 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.67 
 
 		 474 aa  610  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  61.46 
 
 		 473 aa  605  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 		 473 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.5 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.88 
 
 		 473 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  55.96 
 
 		 488 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  55.01 
 
 		 471 aa  524  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  54.6 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  54.64 
 
 		 472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.88 
 
 		 471 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.24 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  56.59 
 
 		 476 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  56.59 
 
 		 476 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  56.59 
 
 		 476 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  51.4 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.75 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3334  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.83 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.43 
 
 		 465 aa  495  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  54 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  54.21 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.12 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  55.14 
 
 		 473 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  54.39 
 
 		 471 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  55.94 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.03 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.45 
 
 		 471 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.56 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  53.33 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  55.94 
 
 		 466 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.13 
 
 		 481 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.8 
 
 		 486 aa  484  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  54.55 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.26 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.83 
 
 		 517 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.05 
 
 		 493 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  54.11 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  52.79 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  53.02 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.16 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  51.28 
 
 		 484 aa  481  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  55.03 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  54.45 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.35 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  52.59 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.34 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  53.68 
 
 		 470 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  53.46 
 
 		 470 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  53.9 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.84 
 
 		 474 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.97 
 
 		 470 aa  478  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.4 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.56 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  53.21 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  54.43 
 
 		 474 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  53.46 
 
 		 473 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  51.94 
 
 		 473 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  51.91 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.27 
 
 		 484 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  53.52 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0285  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.85 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0292162  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2067  isopropylmalate isomerase large subunit  53.85 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1982  isopropylmalate isomerase large subunit  51.62 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.733676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  54.53 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  52.47 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1313  isopropylmalate isomerase large subunit  52.07 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1286  isopropylmalate isomerase large subunit  52.07 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  53.78 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  53.3 
 
 		 480 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  52.44 
 
 		 478 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  52.6 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  51.28 
 
 		 481 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  50.43 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  53.35 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  53.78 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>