More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0626 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.13 
 
 		 474 aa  731    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  80.22 
 
 		 462 aa  763    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  83.26 
 
 		 472 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.55 
 
 		 477 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.25 
 
 		 487 aa  747    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  74.21 
 
 		 481 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 465 aa  956    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.08 
 
 		 493 aa  737    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  79.49 
 
 		 481 aa  770    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.9 
 
 		 479 aa  748    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  73.55 
 
 		 465 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.92 
 
 		 484 aa  750    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  76.56 
 
 		 465 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1358  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  74.2 
 
 		 477 aa  724    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.9 
 
 		 468 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  82.76 
 
 		 471 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.26 
 
 		 486 aa  759    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  78.45 
 
 		 473 aa  764    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  79.06 
 
 		 481 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  69.98 
 
 		 469 aa  689    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  84.3 
 
 		 468 aa  809    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1596  isopropylmalate isomerase large subunit  72.16 
 
 		 467 aa  682    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  81.72 
 
 		 465 aa  783    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.72 
 
 		 481 aa  746    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.25 
 
 		 479 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  75.96 
 
 		 484 aa  746    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.61 
 
 		 517 aa  741    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  79.06 
 
 		 481 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.77 
 
 		 459 aa  736    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  75.97 
 
 		 470 aa  735    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  73.36 
 
 		 481 aa  722    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  73.09 
 
 		 469 aa  687    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  75.74 
 
 		 484 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  82.51 
 
 		 473 aa  781    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.56 
 
 		 471 aa  743    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  79.06 
 
 		 481 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  79.06 
 
 		 481 aa  771    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.03 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 477 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  64.29 
 
 		 471 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 		 474 aa  622  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  65.01 
 
 		 472 aa  618  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  64.03 
 
 		 472 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  64.4 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  64.3 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  65.22 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.22 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  65 
 
 		 466 aa  608  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  65.22 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  65.22 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  65 
 
 		 466 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  65.22 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  65.22 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  65 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  64.78 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  63.36 
 
 		 467 aa  594  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.37 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  62.28 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  63.53 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.31 
 
 		 466 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  61.42 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  63.09 
 
 		 466 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  61.29 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  63.1 
 
 		 470 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  61.42 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  63.08 
 
 		 471 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  63.09 
 
 		 466 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  61.72 
 
 		 466 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  61.42 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  62.86 
 
 		 466 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  63.66 
 
 		 475 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.77 
 
 		 473 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  64.13 
 
 		 469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  62.78 
 
 		 468 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  63 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  63 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  61.91 
 
 		 479 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  63.23 
 
 		 475 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  63 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  64.47 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.29 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  63.82 
 
 		 470 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  63.26 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.53 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0422  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.77 
 
 		 471 aa  578  1e-164  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  63 
 
 		 469 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  62.64 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  63.53 
 
 		 468 aa  578  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  63.45 
 
 		 469 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  62.86 
 
 		 470 aa  578  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  62.47 
 
 		 474 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>