More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4707 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  63.85 
 
 		 772 aa  639    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 479 aa  974    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  65.68 
 
 		 472 aa  648    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  81.86 
 
 		 478 aa  795    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.29 
 
 		 473 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  82.45 
 
 		 476 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  68.09 
 
 		 467 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  65.54 
 
 		 472 aa  631  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  63.56 
 
 		 722 aa  625  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  65.75 
 
 		 475 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  65.54 
 
 		 475 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  65.04 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  64.27 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  64.69 
 
 		 470 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  64.19 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  64.19 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  64.61 
 
 		 466 aa  621  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  64.27 
 
 		 473 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  63.29 
 
 		 469 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  63.35 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  63.77 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  63.14 
 
 		 468 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  62.92 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  62.71 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  62.92 
 
 		 469 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  62.92 
 
 		 469 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  61.54 
 
 		 762 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  63.4 
 
 		 470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  63.25 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  61.73 
 
 		 471 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.17 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  62.37 
 
 		 471 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  61.91 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  62.98 
 
 		 468 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  62.92 
 
 		 480 aa  601  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  59.75 
 
 		 770 aa  598  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  62.11 
 
 		 480 aa  594  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.21 
 
 		 468 aa  595  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  61.7 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  64.83 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  61.7 
 
 		 470 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2520  isopropylmalate isomerase large subunit  65.39 
 
 		 478 aa  594  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1719  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.62 
 
 		 468 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  61.91 
 
 		 465 aa  591  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  62.98 
 
 		 474 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  61.49 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2453  isopropylmalate isomerase large subunit  62.55 
 
 		 487 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.142412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1542  isopropylmalate isomerase large subunit  61.28 
 
 		 474 aa  591  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.690084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  61.7 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0085  isopropylmalate isomerase large subunit  64.54 
 
 		 467 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362256  normal  0.223362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  62.71 
 
 		 470 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0795  isopropylmalate isomerase large subunit  61.49 
 
 		 474 aa  589  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  61.86 
 
 		 469 aa  591  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1485  isopropylmalate isomerase large subunit  61.28 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  61.7 
 
 		 475 aa  591  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  62.69 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  59.58 
 
 		 476 aa  585  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.59 
 
 		 466 aa  586  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  64.54 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  59.58 
 
 		 476 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1180  isopropylmalate isomerase large subunit  63.58 
 
 		 480 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.52 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  59.58 
 
 		 476 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  62.66 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  60.85 
 
 		 477 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  61.06 
 
 		 477 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.23 
 
 		 465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  60.81 
 
 		 466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  61.41 
 
 		 466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  60.81 
 
 		 466 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.81 
 
 		 466 aa  581  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1985  isopropylmalate isomerase large subunit  60.64 
 
 		 477 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682408  normal  0.0241842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  60 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1936  isopropylmalate isomerase large subunit  60.21 
 
 		 478 aa  578  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  60.81 
 
 		 466 aa  581  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.81 
 
 		 469 aa  580  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  60.81 
 
 		 466 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  61.02 
 
 		 466 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  60.59 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  60.59 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  60.81 
 
 		 466 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.39 
 
 		 480 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.75 
 
 		 486 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.49 
 
 		 487 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  61.02 
 
 		 466 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  61.02 
 
 		 466 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  60.85 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  61.28 
 
 		 474 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  60.17 
 
 		 469 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1889  isopropylmalate isomerase large subunit  60.21 
 
 		 472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3608  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  59.75 
 
 		 477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  60.89 
 
 		 468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2582  isopropylmalate isomerase large subunit  60.89 
 
 		 473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  61.18 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>