More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1189 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  64.73 
 
 		 772 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  66.95 
 
 		 466 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.95 
 
 		 466 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1985  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 477 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682408  normal  0.0241842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 477 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  72.83 
 
 		 470 aa  692    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  66.09 
 
 		 469 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  68.31 
 
 		 469 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  66.6 
 
 		 469 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  73.23 
 
 		 469 aa  705    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  68.25 
 
 		 470 aa  663    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.24 
 
 		 475 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 469 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  68.95 
 
 		 722 aa  664    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  70.94 
 
 		 472 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 469 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  67.6 
 
 		 469 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  66.24 
 
 		 474 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  73.99 
 
 		 473 aa  724    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1180  isopropylmalate isomerase large subunit  70.78 
 
 		 480 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  71.15 
 
 		 469 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 475 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  68.88 
 
 		 469 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  68.75 
 
 		 467 aa  667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  71.27 
 
 		 468 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  70.22 
 
 		 470 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  68.03 
 
 		 479 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2935  isopropylmalate isomerase large subunit  67.89 
 
 		 469 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1889  isopropylmalate isomerase large subunit  67.09 
 
 		 472 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  74.35 
 
 		 466 aa  717    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  70.51 
 
 		 475 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  68.25 
 
 		 467 aa  662    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 469 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2164  isopropylmalate isomerase large subunit  68.74 
 
 		 479 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  68.03 
 
 		 469 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 466 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  67.6 
 
 		 477 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 469 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  69.76 
 
 		 469 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  66.17 
 
 		 469 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 472 aa  964    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 469 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  74.35 
 
 		 469 aa  703    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  71.58 
 
 		 470 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3071  isopropylmalate isomerase large subunit  67.45 
 
 		 468 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  67.52 
 
 		 477 aa  651    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  69.76 
 
 		 469 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  65.87 
 
 		 466 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  66.95 
 
 		 466 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  71.74 
 
 		 473 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  68.75 
 
 		 468 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  66.95 
 
 		 466 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  69.81 
 
 		 470 aa  679    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  70.43 
 
 		 470 aa  680    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  65.68 
 
 		 479 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  67.6 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  66.95 
 
 		 466 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  71.15 
 
 		 470 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.96 
 
 		 468 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  69.68 
 
 		 468 aa  669    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  66.95 
 
 		 474 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  69.76 
 
 		 480 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 469 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4273  isopropylmalate isomerase large subunit  66.24 
 
 		 477 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  72.61 
 
 		 470 aa  687    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  66.31 
 
 		 482 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  67.93 
 
 		 476 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  67.17 
 
 		 469 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  65.44 
 
 		 466 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  66.95 
 
 		 469 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  73.23 
 
 		 469 aa  705    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  72.2 
 
 		 469 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  66.31 
 
 		 466 aa  634    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  67.17 
 
 		 466 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  67.09 
 
 		 477 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 469 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  73.06 
 
 		 469 aa  698    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  68.03 
 
 		 469 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  67.6 
 
 		 469 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 474 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  74.14 
 
 		 469 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6850  isopropylmalate isomerase large subunit  67.6 
 
 		 469 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  70.3 
 
 		 475 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 469 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 466 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  67.17 
 
 		 469 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  74.14 
 
 		 469 aa  699    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  66.1 
 
 		 480 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  67.17 
 
 		 469 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.1 
 
 		 470 aa  656    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  67.67 
 
 		 469 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  67.17 
 
 		 466 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  70.32 
 
 		 468 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  67.95 
 
 		 474 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 472 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  74.35 
 
 		 469 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 469 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.1 
 
 		 480 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  64.81 
 
 		 476 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  66.46 
 
 		 473 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>