More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2523 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  64.83 
 
 		 772 aa  634    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0085  isopropylmalate isomerase large subunit  87.21 
 
 		 467 aa  803    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362256  normal  0.223362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  74.09 
 
 		 469 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  73.61 
 
 		 469 aa  704    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  67.16 
 
 		 480 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  68.82 
 
 		 470 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  71.95 
 
 		 469 aa  691    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  69.59 
 
 		 468 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 475 aa  979    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  70.66 
 
 		 468 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  99.58 
 
 		 475 aa  976    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  70.47 
 
 		 469 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  67.88 
 
 		 469 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  96.58 
 
 		 472 aa  919    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  67.88 
 
 		 480 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  71.73 
 
 		 469 aa  681    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  68.31 
 
 		 469 aa  656    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  70.3 
 
 		 472 aa  674    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  70.47 
 
 		 470 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  68.14 
 
 		 478 aa  648    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  85.38 
 
 		 468 aa  786    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  67.45 
 
 		 470 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  70.11 
 
 		 473 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  67.38 
 
 		 468 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  71.73 
 
 		 469 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  69.55 
 
 		 466 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  67.74 
 
 		 470 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  70.26 
 
 		 470 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  68.74 
 
 		 468 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  70.49 
 
 		 473 aa  688    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  84.98 
 
 		 467 aa  792    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.31 
 
 		 468 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  73.61 
 
 		 469 aa  704    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  73.02 
 
 		 469 aa  694    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.91 
 
 		 470 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  71.95 
 
 		 469 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  68.09 
 
 		 467 aa  652    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2520  isopropylmalate isomerase large subunit  85.62 
 
 		 478 aa  787    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  65.75 
 
 		 479 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  66.67 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  634  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  67.53 
 
 		 470 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 466 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 466 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 466 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  66.45 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  63.83 
 
 		 762 aa  627  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  64.62 
 
 		 770 aa  625  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.24 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 466 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  67.45 
 
 		 469 aa  621  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  64.59 
 
 		 722 aa  623  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  65.59 
 
 		 466 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1180  isopropylmalate isomerase large subunit  69.98 
 
 		 480 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  66.59 
 
 		 466 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.59 
 
 		 466 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  67.16 
 
 		 476 aa  619  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  65.81 
 
 		 466 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  66.17 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  64.73 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  64.73 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  64.73 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  66.23 
 
 		 470 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  65.52 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  65.47 
 
 		 482 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  64.9 
 
 		 472 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.67 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  64.83 
 
 		 475 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1485  isopropylmalate isomerase large subunit  64.62 
 
 		 474 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1542  isopropylmalate isomerase large subunit  64.62 
 
 		 474 aa  611  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.690084  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  65.31 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  64.48 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.58 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  65.52 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  64.88 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.81 
 
 		 465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  65.31 
 
 		 469 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  65.74 
 
 		 467 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  64.67 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.79 
 
 		 466 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  63.79 
 
 		 466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  63.58 
 
 		 474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  63.79 
 
 		 474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.21 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  64.45 
 
 		 479 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1889  isopropylmalate isomerase large subunit  63.69 
 
 		 472 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  64.45 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.52 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  64.45 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  64.45 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6850  isopropylmalate isomerase large subunit  64.03 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1223  isopropylmalate isomerase large subunit  64.97 
 
 		 473 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.0157674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>