More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68659 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  61.68 
 
 		 772 aa  954    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  59.3 
 
 		 722 aa  868    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  60.54 
 
 		 762 aa  911    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 770 aa  1588    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  66.6 
 
 		 468 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  65.18 
 
 		 470 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  56.27 
 
 		 801 aa  810    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  65.96 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.06 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  64.54 
 
 		 470 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  65.96 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  65.19 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  63.77 
 
 		 480 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  63.48 
 
 		 468 aa  627  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  64.19 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  64.54 
 
 		 469 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  65.25 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  64.62 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  64.83 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  64.41 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  65.04 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  63.77 
 
 		 469 aa  625  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  63.77 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  63.42 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  63.98 
 
 		 469 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  64.5 
 
 		 472 aa  621  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  64.19 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  63.98 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  64.62 
 
 		 475 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  64.83 
 
 		 475 aa  618  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  64.62 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  63.14 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  62.63 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  64.19 
 
 		 477 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  62.42 
 
 		 468 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  64.19 
 
 		 469 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  62.16 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  61.31 
 
 		 467 aa  612  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  62.47 
 
 		 466 aa  610  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  63.14 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 479 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  63.77 
 
 		 469 aa  612  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  63.21 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6850  isopropylmalate isomerase large subunit  63.35 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  63.64 
 
 		 469 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  63.21 
 
 		 469 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  61.57 
 
 		 472 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  63.14 
 
 		 469 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.9 
 
 		 470 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0624  isopropylmalate isomerase large subunit  62.16 
 
 		 470 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0775  isopropylmalate isomerase large subunit  62.16 
 
 		 470 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.08 
 
 		 469 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  62.37 
 
 		 474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 470 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3071  isopropylmalate isomerase large subunit  62.24 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  63 
 
 		 482 aa  602  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  63.14 
 
 		 469 aa  602  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  62.16 
 
 		 474 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  63 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3229  isopropylmalate isomerase large subunit  62.37 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2582  isopropylmalate isomerase large subunit  62.37 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.66 
 
 		 470 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  59.75 
 
 		 479 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1223  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 473 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.0157674 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1719  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.71 
 
 		 468 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.78 
 
 		 468 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2164  isopropylmalate isomerase large subunit  62.5 
 
 		 479 aa  595  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1485  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1542  isopropylmalate isomerase large subunit  61.73 
 
 		 474 aa  595  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.690084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1985  isopropylmalate isomerase large subunit  61.73 
 
 		 477 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682408  normal  0.0241842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2935  isopropylmalate isomerase large subunit  62.11 
 
 		 469 aa  592  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 477 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3608  isopropylmalate isomerase large subunit  61.39 
 
 		 473 aa  591  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  61.73 
 
 		 477 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  60.25 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1049  isopropylmalate isomerase large subunit  63.21 
 
 		 502 aa  591  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  60.68 
 
 		 472 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.73 
 
 		 475 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1889  isopropylmalate isomerase large subunit  61.31 
 
 		 472 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  61.1 
 
 		 477 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0085  isopropylmalate isomerase large subunit  63.5 
 
 		 467 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362256  normal  0.223362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  58.9 
 
 		 478 aa  588  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  61.73 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2520  isopropylmalate isomerase large subunit  63.52 
 
 		 478 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5235  isopropylmalate isomerase large subunit  61.73 
 
 		 488 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 475 aa  588  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1936  isopropylmalate isomerase large subunit  59.79 
 
 		 478 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>