More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24772 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  60 
 
 		 772 aa  892    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  62.65 
 
 		 722 aa  924    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  59.57 
 
 		 762 aa  875    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  100 
 
 		 801 aa  1650    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  56.27 
 
 		 770 aa  825    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  63.31 
 
 		 472 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  62.85 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.31 
 
 		 473 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  62.98 
 
 		 466 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  63.98 
 
 		 469 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  63.5 
 
 		 469 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  63.42 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  63.5 
 
 		 469 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  62.87 
 
 		 469 aa  602  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  62.85 
 
 		 468 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  62.13 
 
 		 478 aa  596  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  61.34 
 
 		 470 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  63.21 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  62.87 
 
 		 469 aa  596  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  63 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.6 
 
 		 470 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  61.8 
 
 		 480 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.08 
 
 		 468 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  61.22 
 
 		 470 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  63.14 
 
 		 468 aa  595  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  63.14 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  62.45 
 
 		 469 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  62.03 
 
 		 469 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1936  isopropylmalate isomerase large subunit  61.04 
 
 		 478 aa  591  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  61.26 
 
 		 473 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 468 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  60.38 
 
 		 479 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  60.92 
 
 		 469 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  62.16 
 
 		 470 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  62.5 
 
 		 469 aa  591  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  62.29 
 
 		 472 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  62.29 
 
 		 469 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  62.5 
 
 		 475 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.81 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  62.29 
 
 		 475 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  61.44 
 
 		 468 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  61.23 
 
 		 467 aa  580  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  60 
 
 		 480 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  62.71 
 
 		 472 aa  581  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  61.83 
 
 		 470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  60.97 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  61.15 
 
 		 466 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  60.55 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.33 
 
 		 470 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  60.13 
 
 		 469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.64 
 
 		 456 aa  575  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  60.13 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.42 
 
 		 469 aa  572  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2164  isopropylmalate isomerase large subunit  61.81 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  60.76 
 
 		 469 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  59.92 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  59.92 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  59.2 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  60.13 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  59.92 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2520  isopropylmalate isomerase large subunit  62.53 
 
 		 478 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6850  isopropylmalate isomerase large subunit  60.34 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  60.97 
 
 		 469 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1223  isopropylmalate isomerase large subunit  61.05 
 
 		 473 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.0157674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.89 
 
 		 493 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  59.92 
 
 		 469 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  60.34 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  61.57 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3608  isopropylmalate isomerase large subunit  61.68 
 
 		 473 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2453  isopropylmalate isomerase large subunit  62.08 
 
 		 487 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.142412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  61.65 
 
 		 476 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  60.34 
 
 		 469 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3071  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 468 aa  568  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1779  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.49 
 
 		 467 aa  567  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  60.55 
 
 		 468 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  60.34 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.04 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  60.34 
 
 		 469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  60.68 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1795  isopropylmalate isomerase large subunit  60.95 
 
 		 490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.367399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  60.55 
 
 		 468 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  60.55 
 
 		 468 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  61.26 
 
 		 473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3039  isopropylmalate isomerase large subunit  60.82 
 
 		 483 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.65 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  59.02 
 
 		 471 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  60.25 
 
 		 477 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2086  isopropylmalate isomerase large subunit  59.92 
 
 		 472 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  58.81 
 
 		 471 aa  562  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  59.7 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  60 
 
 		 474 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>