More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0194 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  66.31 
 
 		 477 aa  655    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.39 
 
 		 481 aa  659    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  71.62 
 
 		 471 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.4 
 
 		 487 aa  656    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  75.05 
 
 		 465 aa  707    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  70.46 
 
 		 459 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  70.31 
 
 		 472 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  68.31 
 
 		 471 aa  660    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  73.09 
 
 		 465 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  67.38 
 
 		 471 aa  668    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.65 
 
 		 474 aa  669    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  74.62 
 
 		 462 aa  693    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.61 
 
 		 473 aa  634    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 481 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  71.12 
 
 		 465 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  69.28 
 
 		 473 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.45 
 
 		 517 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  68.12 
 
 		 470 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  69.33 
 
 		 481 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  67.17 
 
 		 484 aa  651    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.88 
 
 		 486 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  71.12 
 
 		 468 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 470 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  65.25 
 
 		 474 aa  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1358  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.81 
 
 		 477 aa  638    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  69.33 
 
 		 481 aa  668    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  72.53 
 
 		 469 aa  708    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  68.31 
 
 		 469 aa  634    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  71.55 
 
 		 465 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.24 
 
 		 477 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.3 
 
 		 493 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.67 
 
 		 468 aa  651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  67.31 
 
 		 481 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.05 
 
 		 479 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  66.45 
 
 		 484 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  75.93 
 
 		 473 aa  709    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.37 
 
 		 471 aa  663    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  66.45 
 
 		 484 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  69.33 
 
 		 481 aa  668    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  69.55 
 
 		 481 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  69.98 
 
 		 481 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  65.32 
 
 		 472 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 469 aa  967    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  67.31 
 
 		 480 aa  631  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.05 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  67.31 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  67.31 
 
 		 469 aa  631  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  67.24 
 
 		 469 aa  631  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  67.1 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  66.16 
 
 		 466 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  65.15 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  66.95 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  66.95 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  66.52 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  63.68 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  66.09 
 
 		 470 aa  618  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  66.17 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.38 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  65.67 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.86 
 
 		 479 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  66.31 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  66.17 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.4 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  64.64 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  65.29 
 
 		 466 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  65.45 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  65.15 
 
 		 474 aa  616  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  65.73 
 
 		 469 aa  614  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  64.94 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  65.73 
 
 		 469 aa  614  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  64.64 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  64.64 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  64.64 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  64.64 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  64.52 
 
 		 467 aa  616  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.86 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  64.72 
 
 		 468 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  65.38 
 
 		 477 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  65.73 
 
 		 469 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  64.86 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  64.86 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 467 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  65.52 
 
 		 468 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  65.73 
 
 		 479 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  65.73 
 
 		 469 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  65.52 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  64.72 
 
 		 468 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  64.86 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  65.38 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  64.86 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  65.16 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  64.66 
 
 		 474 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  65.16 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  65.73 
 
 		 469 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  65.16 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  65.02 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  64.66 
 
 		 474 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  65.74 
 
 		 472 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>