More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3215 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1358  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  74.36 
 
 		 477 aa  725    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  71.7 
 
 		 470 aa  701    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  74.84 
 
 		 462 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  76.55 
 
 		 465 aa  746    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.71 
 
 		 479 aa  739    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  80.17 
 
 		 471 aa  764    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  76.97 
 
 		 484 aa  753    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.36 
 
 		 484 aa  767    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.19 
 
 		 465 aa  725    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  81.57 
 
 		 481 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  73.35 
 
 		 465 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.78 
 
 		 486 aa  736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  82.09 
 
 		 472 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  72.28 
 
 		 465 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.8 
 
 		 493 aa  734    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.86 
 
 		 468 aa  746    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.92 
 
 		 517 aa  734    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.5 
 
 		 479 aa  724    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  73.62 
 
 		 474 aa  710    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  81.57 
 
 		 481 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 469 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  82.23 
 
 		 481 aa  790    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.71 
 
 		 487 aa  733    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  77.61 
 
 		 468 aa  749    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1596  isopropylmalate isomerase large subunit  68.87 
 
 		 467 aa  653    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  70.08 
 
 		 481 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  68.85 
 
 		 481 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  79.87 
 
 		 473 aa  786    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  76.55 
 
 		 484 aa  750    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.24 
 
 		 469 aa  642    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  75.73 
 
 		 473 aa  725    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 477 aa  976    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  74.73 
 
 		 471 aa  723    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  75.69 
 
 		 459 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  81.57 
 
 		 481 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  81.74 
 
 		 481 aa  796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  81.95 
 
 		 481 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  62 
 
 		 472 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  61.77 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.96 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  61.75 
 
 		 477 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  63.27 
 
 		 475 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  61.12 
 
 		 471 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  61.59 
 
 		 470 aa  578  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  63.06 
 
 		 475 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  62.88 
 
 		 472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.37 
 
 		 456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  60.08 
 
 		 466 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  61.62 
 
 		 470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  62.39 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  61.62 
 
 		 470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  59.87 
 
 		 472 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.57 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  62.17 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  61.45 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  62.17 
 
 		 480 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  59.96 
 
 		 471 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  61.15 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  61.32 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  61.95 
 
 		 470 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  60.94 
 
 		 468 aa  568  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  61.27 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  61.15 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  59.66 
 
 		 474 aa  567  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  62.55 
 
 		 470 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  61.01 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  59.96 
 
 		 770 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  60.17 
 
 		 474 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  60.49 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  59.44 
 
 		 474 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  61.1 
 
 		 470 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  58.25 
 
 		 762 aa  556  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  60.26 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.23 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  58.84 
 
 		 772 aa  551  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  59.48 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.48 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  60.66 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  59.48 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  62.2 
 
 		 467 aa  551  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  59.48 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  59.17 
 
 		 479 aa  554  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  59.27 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0422  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  59.53 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.96 
 
 		 480 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  59.48 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  58.17 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  60.93 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  60.04 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  59.27 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  59.13 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  56.78 
 
 		 476 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  58.79 
 
 		 474 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  56.78 
 
 		 476 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  59.34 
 
 		 468 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  59.34 
 
 		 468 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  59.05 
 
 		 466 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  60.17 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  59.27 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  59.34 
 
 		 468 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>