More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1596 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  70.51 
 
 		 465 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  67.02 
 
 		 474 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  70.82 
 
 		 471 aa  694    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.87 
 
 		 477 aa  671    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  75.27 
 
 		 493 aa  725    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  72.16 
 
 		 465 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.75 
 
 		 481 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.55 
 
 		 486 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  73.31 
 
 		 484 aa  708    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  69.87 
 
 		 481 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  75.59 
 
 		 517 aa  736    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  66.32 
 
 		 481 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.66 
 
 		 479 aa  743    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  72.38 
 
 		 472 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.16 
 
 		 459 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  73.66 
 
 		 479 aa  726    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  71.58 
 
 		 468 aa  688    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  69.87 
 
 		 481 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  68.1 
 
 		 473 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1596  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 467 aa  963    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.81 
 
 		 468 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  71.97 
 
 		 484 aa  701    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  67.46 
 
 		 470 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  76.87 
 
 		 487 aa  750    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1358  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  73.19 
 
 		 477 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  69.1 
 
 		 473 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.74 
 
 		 471 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  69.87 
 
 		 481 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  69.87 
 
 		 481 aa  680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  70.3 
 
 		 481 aa  683    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  69.81 
 
 		 462 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  71.15 
 
 		 484 aa  682    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  68.52 
 
 		 465 aa  627  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  65.05 
 
 		 481 aa  625  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  67.88 
 
 		 465 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  62.93 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.63 
 
 		 469 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  62.1 
 
 		 466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.88 
 
 		 468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  61.39 
 
 		 477 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  61.57 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  60.34 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  58.97 
 
 		 472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  60.92 
 
 		 466 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  60.74 
 
 		 472 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  58.49 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  59.83 
 
 		 470 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  59.43 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  59.38 
 
 		 469 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  61.49 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  59.87 
 
 		 471 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  61.61 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.37 
 
 		 470 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  60.63 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2164  isopropylmalate isomerase large subunit  60.09 
 
 		 479 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  60.71 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  60.65 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.91 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  60.18 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  61.61 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  58.49 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  58.1 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.66 
 
 		 475 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  58.09 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  58.84 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  59.43 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  59.19 
 
 		 466 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  61.3 
 
 		 468 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3229  isopropylmalate isomerase large subunit  61.29 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2582  isopropylmalate isomerase large subunit  61.29 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  58.1 
 
 		 474 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  59.26 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.26 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  60.22 
 
 		 472 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  59.26 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  59.26 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  58.04 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.35 
 
 		 456 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  60.4 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5235  isopropylmalate isomerase large subunit  60.22 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2086  isopropylmalate isomerase large subunit  58.72 
 
 		 472 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  60.63 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  59.26 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  58.35 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  59.04 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0390  isopropylmalate isomerase large subunit  59.04 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  59.04 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1985  isopropylmalate isomerase large subunit  57.74 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682408  normal  0.0241842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  58.13 
 
 		 469 aa  537  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  57.79 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  59.04 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  60.63 
 
 		 473 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3608  isopropylmalate isomerase large subunit  59.57 
 
 		 473 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  57.96 
 
 		 477 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  59.04 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  58.99 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  58.35 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  57.74 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  58.35 
 
 		 469 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  59 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>