More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1961 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1875  isopropylmalate isomerase large subunit  68.37 
 
 		 478 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  69.7 
 
 		 480 aa  679    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  80.21 
 
 		 477 aa  738    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1980  isopropylmalate isomerase large subunit  69.7 
 
 		 480 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  93.63 
 
 		 472 aa  910    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  69.49 
 
 		 480 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 474 aa  971    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  73.77 
 
 		 471 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.25 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 		 465 aa  622  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  62.77 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3334  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.55 
 
 		 472 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.3 
 
 		 471 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  61.91 
 
 		 471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.09 
 
 		 465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.23 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  64.73 
 
 		 473 aa  598  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  62.8 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  62.58 
 
 		 481 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  60.72 
 
 		 477 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 481 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.94 
 
 		 472 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  62.5 
 
 		 481 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  60.52 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.12 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  60.65 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  63.23 
 
 		 465 aa  579  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.91 
 
 		 486 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  60.94 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  57.36 
 
 		 466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.37 
 
 		 474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  60.64 
 
 		 481 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.06 
 
 		 484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  62.58 
 
 		 465 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  60.77 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.57 
 
 		 481 aa  568  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  60.08 
 
 		 481 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.22 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.17 
 
 		 517 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.66 
 
 		 477 aa  567  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1358  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.87 
 
 		 477 aa  565  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.87 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  59.87 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  59.11 
 
 		 467 aa  568  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0285  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.06 
 
 		 481 aa  566  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0292162  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.34 
 
 		 479 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  59.87 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  59.31 
 
 		 466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.31 
 
 		 466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  59.1 
 
 		 466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  59.31 
 
 		 466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.31 
 
 		 471 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  59.1 
 
 		 466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.27 
 
 		 479 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.17 
 
 		 493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  59.31 
 
 		 466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.57 
 
 		 459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  59.31 
 
 		 466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  58.85 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  58.21 
 
 		 484 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  59.1 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  59.1 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.06 
 
 		 456 aa  555  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  59.1 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  59.1 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  59.1 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  59.79 
 
 		 470 aa  557  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1982  isopropylmalate isomerase large subunit  59.28 
 
 		 465 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.733676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  58.97 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  57.78 
 
 		 484 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.78 
 
 		 471 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.1 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  58.37 
 
 		 466 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  58.89 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  58.8 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  58.24 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  57.78 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  58.03 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  58.8 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  58.24 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.91 
 
 		 468 aa  551  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  58.8 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  59.33 
 
 		 466 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  58.24 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0390  isopropylmalate isomerase large subunit  58.24 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  57.78 
 
 		 469 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  57.6 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  57.57 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  58.14 
 
 		 478 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  58.58 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  58.58 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  57.57 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  56.32 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.72 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  56.72 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.32 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  57.6 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  56.66 
 
 		 472 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.03 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  57.68 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>