More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2129 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  67.16 
 
 		 466 aa  634    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  67.93 
 
 		 472 aa  663    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  67.73 
 
 		 467 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  84 
 
 		 478 aa  810    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 476 aa  961    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  67.65 
 
 		 472 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  82.45 
 
 		 479 aa  801    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  67.37 
 
 		 475 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  67.16 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  63.24 
 
 		 772 aa  627  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  67.02 
 
 		 480 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  65.33 
 
 		 469 aa  627  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  67.02 
 
 		 469 aa  631  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  65.33 
 
 		 468 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  64.27 
 
 		 469 aa  621  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  64.9 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  66.17 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  65.75 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  64.41 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  64.1 
 
 		 722 aa  614  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  65.12 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  64.69 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  64.97 
 
 		 470 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  65.39 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  64.41 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  64.69 
 
 		 469 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.16 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.39 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  65.32 
 
 		 473 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  64.69 
 
 		 468 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  64.68 
 
 		 470 aa  611  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  64.12 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  64.89 
 
 		 470 aa  609  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  64.76 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.76 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  64.76 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  62.53 
 
 		 762 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.76 
 
 		 466 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.91 
 
 		 470 aa  606  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  64.76 
 
 		 466 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  65.32 
 
 		 466 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  63.48 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  63.42 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  64.54 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  64.76 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  64.76 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  65.32 
 
 		 466 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  65.32 
 
 		 466 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  64.54 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  65.32 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  65.32 
 
 		 466 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  64.26 
 
 		 470 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  64.54 
 
 		 466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.41 
 
 		 468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  66.53 
 
 		 467 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  63.91 
 
 		 466 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2520  isopropylmalate isomerase large subunit  66.38 
 
 		 478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  63.4 
 
 		 482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  64.12 
 
 		 466 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  64.76 
 
 		 466 aa  601  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  61.6 
 
 		 471 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  63.48 
 
 		 474 aa  598  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  63.45 
 
 		 476 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  63.45 
 
 		 476 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  63.45 
 
 		 476 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1542  isopropylmalate isomerase large subunit  62.21 
 
 		 474 aa  595  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.690084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  63.83 
 
 		 467 aa  594  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  63.27 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1485  isopropylmalate isomerase large subunit  62.21 
 
 		 474 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  62.42 
 
 		 475 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.79 
 
 		 480 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0085  isopropylmalate isomerase large subunit  65.61 
 
 		 467 aa  591  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362256  normal  0.223362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  61.78 
 
 		 472 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  62.69 
 
 		 470 aa  588  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1180  isopropylmalate isomerase large subunit  65.32 
 
 		 480 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  62.55 
 
 		 465 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1889  isopropylmalate isomerase large subunit  61.78 
 
 		 472 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  61.86 
 
 		 474 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  61.32 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  62.08 
 
 		 474 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  58.81 
 
 		 770 aa  587  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  64.54 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  61.73 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0390  isopropylmalate isomerase large subunit  61.7 
 
 		 469 aa  587  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.23 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.77 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  61.72 
 
 		 481 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  62.58 
 
 		 480 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  61.57 
 
 		 477 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  61.72 
 
 		 481 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  61.72 
 
 		 481 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  61.65 
 
 		 801 aa  578  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.28 
 
 		 475 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  61.15 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  61.73 
 
 		 468 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  61.15 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2453  isopropylmalate isomerase large subunit  61.86 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.142412  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  61.59 
 
 		 477 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  61.52 
 
 		 468 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  61.86 
 
 		 469 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>