More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0323 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.87 
 
 		 474 aa  665    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  72.73 
 
 		 468 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  65.66 
 
 		 471 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  64.36 
 
 		 469 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  70.72 
 
 		 467 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  64.29 
 
 		 472 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  72.39 
 
 		 468 aa  700    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  70.56 
 
 		 468 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  66.09 
 
 		 474 aa  662    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  73.32 
 
 		 467 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  68.98 
 
 		 467 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  72.73 
 
 		 468 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  66.16 
 
 		 472 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  65.8 
 
 		 478 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  64.36 
 
 		 469 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 468 aa  970    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  63.12 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  65.58 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  63.99 
 
 		 467 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  63.34 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  62.47 
 
 		 468 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.5 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.61 
 
 		 474 aa  595  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 473 aa  589  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  59.18 
 
 		 473 aa  585  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  59.91 
 
 		 473 aa  581  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.04 
 
 		 473 aa  578  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  54.62 
 
 		 488 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.87 
 
 		 469 aa  518  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  54.96 
 
 		 467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  53.83 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.74 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  51.81 
 
 		 471 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  54.27 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  54.27 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  52.89 
 
 		 474 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  53.96 
 
 		 471 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  53.63 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  54.31 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  52.59 
 
 		 465 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  54.29 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  51.62 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0085  isopropylmalate isomerase large subunit  54.51 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362256  normal  0.223362 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  53.1 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.72 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  53.65 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  51.62 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.9 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  52.47 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.76 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  52.68 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.39 
 
 		 471 aa  481  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  52.45 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.61 
 
 		 472 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.25 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  53.55 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  52.47 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0422  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.7 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  50.64 
 
 		 484 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.43 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.45 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  50.21 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  50.52 
 
 		 762 aa  479  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  51.82 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.18 
 
 		 517 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1982  isopropylmalate isomerase large subunit  52.05 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.733676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  54.09 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  53.8 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  52.35 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  53.45 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  53.55 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  50.97 
 
 		 473 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  52.8 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  53.9 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.6 
 
 		 473 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  51.82 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1887  isopropylmalate isomerase large subunit  49.89 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.574068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 466 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  53.25 
 
 		 470 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0015  isopropylmalate isomerase large subunit  49.89 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 466 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  53.03 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.12 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  51.82 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2094  isopropylmalate isomerase large subunit  49.89 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>