More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02821 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  69.38 
 
 		 467 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  69.87 
 
 		 468 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  70.15 
 
 		 468 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  70.66 
 
 		 467 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  75.05 
 
 		 469 aa  753    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  71.09 
 
 		 467 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  68.95 
 
 		 467 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  76.61 
 
 		 472 aa  746    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  77.14 
 
 		 472 aa  768    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  69.08 
 
 		 469 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  69.94 
 
 		 469 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  71.58 
 
 		 468 aa  701    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  69.87 
 
 		 468 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  75.48 
 
 		 469 aa  757    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 471 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  69.66 
 
 		 468 aa  701    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  78.89 
 
 		 478 aa  785    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.66 
 
 		 468 aa  633  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.85 
 
 		 474 aa  613  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  61.85 
 
 		 474 aa  610  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  60.94 
 
 		 472 aa  598  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  60.17 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  59.96 
 
 		 473 aa  586  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.53 
 
 		 474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  59.74 
 
 		 473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.74 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.44 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  53.53 
 
 		 488 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.36 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.47 
 
 		 471 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  51.83 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  51.59 
 
 		 472 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  51.91 
 
 		 471 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  53.32 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  50.11 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  52.79 
 
 		 473 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  52.69 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  50.63 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.61 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  52.16 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.16 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.16 
 
 		 471 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.43 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3334  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.53 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.66 
 
 		 468 aa  485  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  49.89 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  50.84 
 
 		 481 aa  484  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.85 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  52.29 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  52.29 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  51.28 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.57 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.54 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  49.68 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.43 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  49.68 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  49.68 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  52.89 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  52.69 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  52.69 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  50.44 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  52.69 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  51.71 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  52.16 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  51.18 
 
 		 722 aa  478  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  52.99 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  51.3 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.94 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  51.63 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.78 
 
 		 487 aa  475  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  50.99 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0285  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.22 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0292162  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  49.05 
 
 		 486 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  50.21 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  53.19 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  53 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  49.25 
 
 		 481 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  51.72 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  53.32 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  52.89 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.43 
 
 		 479 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  50.32 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  50.32 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  51.94 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.65 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0624  isopropylmalate isomerase large subunit  52.55 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  49.36 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  51.93 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.11 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  51.08 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  51.83 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  51.83 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  51.72 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0775  isopropylmalate isomerase large subunit  52.55 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  53.03 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  52.15 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  51.93 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  51.94 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>