More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3742 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1307  isopropylmalate isomerase large subunit  63.44 
 
 		 464 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3675  isopropylmalate isomerase large subunit  64.94 
 
 		 467 aa  638    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1982  isopropylmalate isomerase large subunit  69.46 
 
 		 465 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.733676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 466 aa  966    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5902  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.15 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3425  isopropylmalate isomerase large subunit  61.94 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  58.42 
 
 		 472 aa  587  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  59.02 
 
 		 471 aa  579  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  57.36 
 
 		 474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  58.92 
 
 		 466 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  59.14 
 
 		 466 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  58.49 
 
 		 466 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  58.49 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.85 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  56.9 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  56.93 
 
 		 474 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  57.02 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  56.68 
 
 		 474 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  57.02 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  57.11 
 
 		 468 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  56.9 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  57.02 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  58.06 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.06 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  58.06 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  57.85 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  58.06 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  57.85 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.99 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  56.49 
 
 		 468 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  56.71 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  58.06 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  58.06 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  55.6 
 
 		 466 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  57.85 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  56.74 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  56.71 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  56.78 
 
 		 480 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  55.79 
 
 		 466 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  57.27 
 
 		 471 aa  549  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2067  isopropylmalate isomerase large subunit  58.58 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  56.78 
 
 		 480 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  55.79 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.48 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  57.02 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  58.72 
 
 		 477 aa  547  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 466 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  57.42 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1980  isopropylmalate isomerase large subunit  56.38 
 
 		 480 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  57.42 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  57.42 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  55.51 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  57.42 
 
 		 466 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  57.42 
 
 		 466 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  55.39 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  56.16 
 
 		 467 aa  541  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0336  isopropylmalate isomerase large subunit  54.55 
 
 		 482 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  56.59 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.02 
 
 		 493 aa  541  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  56.34 
 
 		 470 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.22 
 
 		 517 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  56.01 
 
 		 477 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  56.8 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  54.76 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  57.08 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.64 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.39 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  56.86 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.3 
 
 		 465 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.22 
 
 		 487 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  55.84 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  54.76 
 
 		 474 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  56.5 
 
 		 482 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  54.82 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.44 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  55.72 
 
 		 472 aa  537  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  56.44 
 
 		 470 aa  535  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  54.97 
 
 		 474 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  55.27 
 
 		 475 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  55.77 
 
 		 468 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.28 
 
 		 469 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  54.53 
 
 		 467 aa  531  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  54.6 
 
 		 470 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  56.59 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  57.02 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  57.14 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1889  isopropylmalate isomerase large subunit  54.45 
 
 		 472 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  54.97 
 
 		 474 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  54.62 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  56.83 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  55.97 
 
 		 468 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  56.83 
 
 		 473 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  57.02 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.47 
 
 		 473 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.1 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  56.83 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1485  isopropylmalate isomerase large subunit  55.06 
 
 		 474 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.08 
 
 		 471 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.86 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  57.14 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>