More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2067 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  82.54 
 
 		 466 aa  793    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  82.54 
 
 		 466 aa  793    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4210  isopropylmalate isomerase large subunit  67.45 
 
 		 471 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  80.13 
 
 		 466 aa  773    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  72.94 
 
 		 474 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  72.14 
 
 		 466 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  73 
 
 		 474 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2067  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 467 aa  970    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  82.54 
 
 		 466 aa  793    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  72.53 
 
 		 468 aa  704    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  80.39 
 
 		 466 aa  776    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  79.4 
 
 		 476 aa  778    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  79.4 
 
 		 476 aa  778    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  72.35 
 
 		 466 aa  691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  81.17 
 
 		 466 aa  777    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  72.1 
 
 		 468 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  79.7 
 
 		 466 aa  773    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  82.33 
 
 		 466 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  79.91 
 
 		 466 aa  774    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  72.14 
 
 		 466 aa  692    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  67.67 
 
 		 466 aa  651    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0336  isopropylmalate isomerase large subunit  71.18 
 
 		 482 aa  689    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  89.89 
 
 		 471 aa  862    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  82.33 
 
 		 466 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  82.33 
 
 		 466 aa  792    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  82.33 
 
 		 466 aa  790    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  82.11 
 
 		 466 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  81.25 
 
 		 466 aa  770    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  72.32 
 
 		 468 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3270  isopropylmalate isomerase large subunit  67.53 
 
 		 468 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  71.92 
 
 		 466 aa  690    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0390  isopropylmalate isomerase large subunit  73.59 
 
 		 469 aa  707    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  73.16 
 
 		 474 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  73.04 
 
 		 474 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  69.91 
 
 		 470 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  82.33 
 
 		 466 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  79.4 
 
 		 476 aa  778    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  82.11 
 
 		 466 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  82.54 
 
 		 466 aa  793    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  82.33 
 
 		 466 aa  792    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  82.54 
 
 		 466 aa  793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  73.16 
 
 		 474 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  82.54 
 
 		 466 aa  795    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  73.81 
 
 		 470 aa  701    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  72.32 
 
 		 468 aa  703    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  92.01 
 
 		 466 aa  876    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  92.22 
 
 		 466 aa  877    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  63.66 
 
 		 477 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  64.95 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  66.24 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 		 472 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  66.24 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  64.66 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2582  isopropylmalate isomerase large subunit  67.02 
 
 		 473 aa  615  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3229  isopropylmalate isomerase large subunit  67.02 
 
 		 473 aa  614  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.25 
 
 		 473 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  63.46 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  64.53 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  61.72 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  64.58 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  63.46 
 
 		 475 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  62.13 
 
 		 482 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  64.1 
 
 		 469 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  64.24 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 		 469 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  63.33 
 
 		 475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  63.38 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 		 469 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5235  isopropylmalate isomerase large subunit  65.96 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  62.1 
 
 		 470 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  63.89 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  62.69 
 
 		 475 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  64.1 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  61.54 
 
 		 474 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1485  isopropylmalate isomerase large subunit  63.11 
 
 		 474 aa  599  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  63.89 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1542  isopropylmalate isomerase large subunit  63.11 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.690084  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3608  isopropylmalate isomerase large subunit  64.68 
 
 		 473 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 		 477 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  63.6 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  63.36 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6850  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  61.75 
 
 		 472 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.42 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.54 
 
 		 475 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  63.58 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  62.31 
 
 		 479 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 481 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  63.75 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>