More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1850 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  68.55 
 
 		 467 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  91.14 
 
 		 474 aa  909    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  65.23 
 
 		 467 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  66.09 
 
 		 467 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  74.52 
 
 		 472 aa  753    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  67.17 
 
 		 468 aa  650    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  100 
 
 		 474 aa  981    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  68.18 
 
 		 468 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.23 
 
 		 470 aa  671    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  68.18 
 
 		 468 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.09 
 
 		 468 aa  642    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  66.16 
 
 		 468 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  62.07 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  61.64 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  63.81 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  63.5 
 
 		 478 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  64.07 
 
 		 472 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  61.85 
 
 		 471 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  59.22 
 
 		 467 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  58.75 
 
 		 469 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  60.61 
 
 		 469 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  59.87 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.18 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  58.76 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  59.18 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  59.4 
 
 		 473 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  56.36 
 
 		 488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.53 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  55.81 
 
 		 472 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.88 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  56.4 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  55.63 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.94 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  55.48 
 
 		 467 aa  521  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.48 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  54.66 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  58.19 
 
 		 471 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  54.51 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  56.47 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  54.04 
 
 		 762 aa  506  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.19 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.45 
 
 		 481 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  55 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  54.39 
 
 		 477 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  53.88 
 
 		 481 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.88 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  53.76 
 
 		 472 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 481 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.8 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  53.55 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  53.76 
 
 		 475 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  52.59 
 
 		 472 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.07 
 
 		 486 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.23 
 
 		 471 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  53.65 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.65 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  53.65 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  53.65 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.29 
 
 		 466 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  53.43 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  53.43 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.22 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  54.18 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  53.65 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  54.62 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  52.44 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  53.57 
 
 		 722 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  52.02 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  55.53 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  53.43 
 
 		 466 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.69 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  54.16 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.88 
 
 		 459 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.08 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  53.04 
 
 		 473 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  53.43 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  53.43 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.25 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.68 
 
 		 517 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  53.45 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  54.45 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  54.45 
 
 		 772 aa  490  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  53.65 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.44 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  53.83 
 
 		 480 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  52.44 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.46 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  51.59 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.25 
 
 		 479 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  51.48 
 
 		 481 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>