More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1604 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 467 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  68.83 
 
 		 468 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 474 aa  982    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  68.91 
 
 		 468 aa  657    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  66.31 
 
 		 467 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  91.14 
 
 		 474 aa  909    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.87 
 
 		 468 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  68.83 
 
 		 468 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  68.76 
 
 		 467 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  68.1 
 
 		 468 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  75.96 
 
 		 472 aa  764    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  70.64 
 
 		 470 aa  686    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  61.64 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  61.85 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  65.02 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  64.15 
 
 		 478 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  65.15 
 
 		 472 aa  617  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  61.85 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  59.4 
 
 		 469 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  59.87 
 
 		 467 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 473 aa  591  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  61.04 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  60.78 
 
 		 473 aa  589  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.26 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  59.65 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  59.53 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.28 
 
 		 473 aa  568  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  57.45 
 
 		 488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.79 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  55.97 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  54.97 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  54.56 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.59 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  54.45 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.06 
 
 		 472 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  54.84 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  54.53 
 
 		 481 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.59 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  53.44 
 
 		 762 aa  508  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  53.65 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  54.31 
 
 		 481 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.66 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.76 
 
 		 517 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.55 
 
 		 487 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  55.22 
 
 		 473 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.1 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.09 
 
 		 481 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.98 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  52.97 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  52.87 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  57.33 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.66 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  52.97 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  54.6 
 
 		 722 aa  499  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  55.6 
 
 		 471 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  53.91 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  51.94 
 
 		 472 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.94 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  52.75 
 
 		 481 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  54.72 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  54.72 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.08 
 
 		 486 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.68 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  52.23 
 
 		 484 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  54.72 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  54.72 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  54.72 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.82 
 
 		 479 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  54.08 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.08 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  54.08 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  54.31 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  54.08 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.72 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  54.31 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  54.33 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  53.29 
 
 		 479 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  52.47 
 
 		 472 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  54.08 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  54.51 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  52.89 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  54.19 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  54.08 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  54.31 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.22 
 
 		 459 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  53.9 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  54.58 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  54.46 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  53.86 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  54.11 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  52.27 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1307  isopropylmalate isomerase large subunit  54.08 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.25 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.46 
 
 		 479 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  54.64 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  54.47 
 
 		 480 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>