More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1546 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  100 
 
 		 488 aa  983    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.45 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  56.51 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.36 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  55.77 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  55.77 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  55.96 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  55.25 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  54.16 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  56.01 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.3 
 
 		 467 aa  531  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  51.48 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  53.53 
 
 		 471 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  54.6 
 
 		 478 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  50.43 
 
 		 469 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  51.17 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  51.61 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  50.75 
 
 		 469 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  53.6 
 
 		 472 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  51.5 
 
 		 468 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  54.72 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.78 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.09 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  53.76 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  50.97 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.96 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  49.47 
 
 		 473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.11 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  47.22 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.96 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  47.01 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  48.74 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  47.42 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  47.64 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  47.85 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  47.47 
 
 		 772 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  47 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  47.87 
 
 		 722 aa  425  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.77 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  46.22 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  46.7 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  45.3 
 
 		 762 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  46.62 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  48.18 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  46.72 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  46.5 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  45.73 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.81 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.58 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  46.43 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  48.72 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  46.51 
 
 		 480 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  46.2 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  47.74 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.62 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  46.12 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.13 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  45.96 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  45.65 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  48.52 
 
 		 801 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.27 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  42.31 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  46.64 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  45.71 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  44.97 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  45.44 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.44 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  45.13 
 
 		 481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  46.07 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  45.22 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.76 
 
 		 479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  46.07 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  46.37 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  47.96 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  46.54 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  46.37 
 
 		 475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  47.03 
 
 		 477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  45.92 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  45.44 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  46.07 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  45.65 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  45.44 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  45.34 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  45.44 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  48.09 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.07 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  45.34 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  45.22 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  46.04 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  46.07 
 
 		 466 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1936  isopropylmalate isomerase large subunit  46.28 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  47.26 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  46.04 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  46.4 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  45.73 
 
 		 472 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  46.06 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  45.23 
 
 		 486 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  47.47 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  45.82 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  46.07 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>