More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2088 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  72.75 
 
 		 467 aa  720    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  72.75 
 
 		 469 aa  731    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  74.03 
 
 		 467 aa  737    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  74.03 
 
 		 468 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  68.67 
 
 		 469 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  73.61 
 
 		 468 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 472 aa  964    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  89.62 
 
 		 472 aa  861    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  73.39 
 
 		 469 aa  735    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 469 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  76.56 
 
 		 468 aa  732    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  73.61 
 
 		 468 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  67.81 
 
 		 467 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  83.69 
 
 		 478 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  67.6 
 
 		 468 aa  674    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  76.61 
 
 		 471 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  72.32 
 
 		 467 aa  721    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.15 
 
 		 474 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.58 
 
 		 468 aa  627  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.07 
 
 		 474 aa  625  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  63.28 
 
 		 472 aa  612  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  60.81 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.34 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 473 aa  571  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  58.46 
 
 		 473 aa  568  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.03 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.89 
 
 		 473 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.39 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.2 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.3 
 
 		 465 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  56.11 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  54.72 
 
 		 488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  55.22 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.82 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.25 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  54.39 
 
 		 471 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.83 
 
 		 472 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  56.67 
 
 		 473 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  53.73 
 
 		 471 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  55.29 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.6 
 
 		 481 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  54.58 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.68 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  53.7 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  54.68 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3298  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.9 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.31 
 
 		 477 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  54.53 
 
 		 472 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  56.22 
 
 		 476 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  56.22 
 
 		 476 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  55.08 
 
 		 481 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  55.08 
 
 		 481 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  56.22 
 
 		 476 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  55.08 
 
 		 481 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.98 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.66 
 
 		 470 aa  494  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  55.94 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  53.75 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  53.8 
 
 		 468 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.86 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.72 
 
 		 466 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  52.99 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  56.33 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  56.18 
 
 		 474 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  54.39 
 
 		 722 aa  491  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  54.6 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.21 
 
 		 486 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  53.8 
 
 		 470 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  53.78 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  54.01 
 
 		 470 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.02 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  56.4 
 
 		 474 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.29 
 
 		 479 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  54.45 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  56.4 
 
 		 474 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  55.72 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  54.88 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  55.02 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0775  isopropylmalate isomerase large subunit  56.69 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  54.7 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.87 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  53.35 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  54.01 
 
 		 473 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  55.97 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  53.8 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  56.3 
 
 		 474 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  55.58 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  54.84 
 
 		 466 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0624  isopropylmalate isomerase large subunit  56.69 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  54.96 
 
 		 468 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1889  isopropylmalate isomerase large subunit  55.93 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  55.9 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  55.56 
 
 		 468 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  55.17 
 
 		 468 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  54.91 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  54.01 
 
 		 468 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0285  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.08 
 
 		 481 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0292162  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.16 
 
 		 471 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>