More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0872 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2656  isopropylmalate isomerase large subunit  80.72 
 
 		 473 aa  785    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0642  isopropylmalate isomerase large subunit  80.85 
 
 		 473 aa  785    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0901  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  81.02 
 
 		 474 aa  794    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  82.03 
 
 		 473 aa  791    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0872  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 473 aa  966    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0214  isopropylmalate isomerase large subunit  64.45 
 
 		 468 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00986239  hitchhiker  0.0021568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0849  isopropylmalate isomerase large subunit  64.45 
 
 		 467 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0217  isopropylmalate isomerase large subunit  64.45 
 
 		 468 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  63.6 
 
 		 467 aa  616  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5028  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  62.53 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  64.73 
 
 		 468 aa  610  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00568531  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  62.74 
 
 		 468 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  59.96 
 
 		 469 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  59.96 
 
 		 469 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02791  isopropylmalate isomerase large subunit  58.67 
 
 		 467 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0248029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02781  isopropylmalate isomerase large subunit  58.03 
 
 		 468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02821  isopropylmalate isomerase large subunit  59.74 
 
 		 471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1850  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  59.4 
 
 		 474 aa  574  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.53 
 
 		 474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02891  isopropylmalate isomerase large subunit  56.53 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.81083  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0258  isopropylmalate isomerase large subunit  58.03 
 
 		 469 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24691  isopropylmalate isomerase large subunit  59.31 
 
 		 478 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0323  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.91 
 
 		 468 aa  558  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000670591  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2088  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 		 472 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2680  isopropylmalate isomerase large subunit  57.69 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0666  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.17 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  53.76 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  52.45 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.11 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  52.55 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  52.37 
 
 		 476 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  52.04 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.37 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  52.37 
 
 		 476 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  53.75 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  52.37 
 
 		 476 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  51.6 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  53.35 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  52.16 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  52.27 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.9 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  51.83 
 
 		 466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 469 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  53.75 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  51.62 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  52.35 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  52.7 
 
 		 469 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  52.27 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  53.35 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  52.16 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  51.07 
 
 		 472 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  53.35 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  49.68 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  52.92 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.04 
 
 		 466 aa  465  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  51.72 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  52.65 
 
 		 722 aa  462  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  49.46 
 
 		 466 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  50.85 
 
 		 474 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.61 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  52.44 
 
 		 470 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  53.35 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0422  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  51.91 
 
 		 471 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  50 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.63 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  51.61 
 
 		 477 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  51.94 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  51.72 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  52.79 
 
 		 470 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  51.4 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  51.4 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  50 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  51.4 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  52.44 
 
 		 772 aa  456  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.21 
 
 		 487 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  50.64 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  51.93 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  51.18 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 466 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.53 
 
 		 471 aa  458  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2067  isopropylmalate isomerase large subunit  50.43 
 
 		 467 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  50.97 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4210  isopropylmalate isomerase large subunit  49.46 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.5 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  51.08 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  51.4 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  47.52 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0390  isopropylmalate isomerase large subunit  50.21 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>