More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3334 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3334  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 472 aa  962    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  62.55 
 
 		 474 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1898  isopropylmalate isomerase large subunit  65.47 
 
 		 480 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  65.25 
 
 		 480 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1980  isopropylmalate isomerase large subunit  64.62 
 
 		 480 aa  604  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  61.41 
 
 		 471 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  62.18 
 
 		 472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0285  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.38 
 
 		 481 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0292162  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1875  isopropylmalate isomerase large subunit  64.32 
 
 		 478 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  63.56 
 
 		 477 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  58.33 
 
 		 481 aa  551  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.33 
 
 		 471 aa  545  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  57.29 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.02 
 
 		 477 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.5 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  57.02 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  57.02 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  57.23 
 
 		 481 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  58.81 
 
 		 467 aa  528  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6006  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.69 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519027  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  57.63 
 
 		 473 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  54.74 
 
 		 471 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  53.63 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  55.56 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  55.96 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  55.29 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.17 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.72 
 
 		 468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.3 
 
 		 459 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  54.01 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  55.95 
 
 		 481 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.17 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3621  isopropylmalate isomerase large subunit  59.11 
 
 		 465 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  55.39 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  57.69 
 
 		 473 aa  511  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  55.18 
 
 		 474 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  54.26 
 
 		 469 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.08 
 
 		 481 aa  511  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  56.89 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  54.47 
 
 		 469 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  55.25 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  55.18 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.25 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.19 
 
 		 493 aa  508  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  53.4 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  55.91 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  55.2 
 
 		 470 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2357  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.82 
 
 		 517 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  54.83 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  54.04 
 
 		 469 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  55.74 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.74 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  55.7 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  53.73 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  53.6 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  55.74 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  55.74 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.53 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 472 aa  501  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  55.88 
 
 		 476 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  55.88 
 
 		 476 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  54.26 
 
 		 469 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  55.74 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  55.53 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  55.53 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  54.91 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  55.88 
 
 		 476 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.8 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  53.62 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  55.74 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.94 
 
 		 487 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  53.83 
 
 		 469 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  55.46 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  53.73 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.64 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.88 
 
 		 470 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  53.6 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  55.7 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3967  isopropylmalate isomerase large subunit  53.4 
 
 		 467 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177679  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18560  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.94 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.242112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  53.94 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0256  isopropylmalate isomerase large subunit  54.37 
 
 		 472 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.809992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.66 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  55.53 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  55.32 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  55.08 
 
 		 480 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.76 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  55.72 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  54.85 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  55.53 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  55.7 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  55.53 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  55.22 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  54.66 
 
 		 480 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  53.73 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  55.53 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  55.53 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  55.53 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  53.49 
 
 		 471 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>