More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0805 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  71.54 
 
 		 131 aa  201  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  67.18 
 
 		 131 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  64.62 
 
 		 130 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  50.76 
 
 		 132 aa  147  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  51.91 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  51.15 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  50.76 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  51.91 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  49.62 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  47.73 
 
 		 132 aa  130  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  44.09 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  41.27 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 745 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01800  Two-component system protein B Precursor (EC 2.7.13.3)(Protein NHK1)(SLN1 homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P4U6]  30.6 
 
 		 1065 aa  73.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  39.36 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  34.88 
 
 		 828 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 757 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 		 636 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 801 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  40.52 
 
 		 513 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 752 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1116 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  33.33 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  32.12 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 962 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  34.19 
 
 		 445 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.68 
 
 		 575 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2642  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1234  EAL domain protein  32.35 
 
 		 589 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.89994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.08 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1021 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1691 aa  63.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 957 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  31.01 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2327  ATP-binding region ATPase domain protein  32.26 
 
 		 758 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 871 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  28.12 
 
 		 2312 aa  62.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  37.3 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 754 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1791 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1713 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  32.28 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111636 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04818  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06140)  30.71 
 
 		 1243 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.25404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  32.81 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.81 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1068 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.03 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.81 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.16 
 
 		 225 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  30.95 
 
 		 588 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.16 
 
 		 225 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  27.56 
 
 		 1135 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1075 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.81 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  31.45 
 
 		 578 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  37.5 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 862 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  32.8 
 
 		 671 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 810 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2837  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000598352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3093  histidine kinase  32.28 
 
 		 554 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.2154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  34.4 
 
 		 460 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  30.08 
 
 		 765 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1285 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5142  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.46 
 
 		 224 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84973  histidine kinase osmosensor Osmolarity two-component system protein SLN1  28.06 
 
 		 1168 aa  61.2  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.656577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  32.81 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0280  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 295 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.932912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.65 
 
 		 703 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1567  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1480 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.35 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>