More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1742 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  61.07 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  59.54 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  56.06 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  55.73 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  55.3 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  53.03 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  50.38 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  47.73 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  46.92 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  49.62 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  47.33 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  39.69 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  37.4 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  32.33 
 
 		 2272 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.59 
 
 		 715 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  35.61 
 
 		 765 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 752 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  31.06 
 
 		 2303 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 745 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 577 aa  67  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1054 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1313 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  36.64 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  31.58 
 
 		 2279 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 890 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1055 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1713 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  35.71 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 223 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03400  two-component sensor molecule, putative  32.39 
 
 		 1617 aa  63.9  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.64378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 234 aa  63.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  36.84 
 
 		 734 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.88 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1134 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 636 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 932 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  30.23 
 
 		 736 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  32.03 
 
 		 698 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 1027 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 452 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 754 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  36.72 
 
 		 244 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4108  diguanylate cyclase  30.3 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.87577  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  35.43 
 
 		 306 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  32 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 1153 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0710  DNA-binding response regulator  35.88 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00420398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1079  CBS sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.721589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1255 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.37 
 
 		 703 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1680 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  35.66 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  36.72 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.3 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0057  putative membrane associated response regulator  32.77 
 
 		 741 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  33.07 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  35.66 
 
 		 272 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  33.86 
 
 		 1347 aa  60.5  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 685 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  43.59 
 
 		 1028 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.59 
 
 		 318 aa  60.1  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0053  membrane associated response regulator,histidine kinase  33.59 
 
 		 818 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255701  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 685 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  35.71 
 
 		 799 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  34.15 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  35.16 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  34.96 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  35.2 
 
 		 755 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1548 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 812 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 803 aa  59.3  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 602 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>