More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0774 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  74.81 
 
 		 132 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  73.28 
 
 		 132 aa  207  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  58.02 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  57.25 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  53.03 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  52.67 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  50.77 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  50.76 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  48.46 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  50.78 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  44.7 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  43.1 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 991 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  38.1 
 
 		 676 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1177 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1038 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1137 aa  70.5  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  38.1 
 
 		 1137 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1159 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 1143 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1054 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.92 
 
 		 703 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 614 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  34.33 
 
 		 755 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 754 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 745 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1055 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1141 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 752 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.66 
 
 		 1499 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1269  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.94 
 
 		 705 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  47.95 
 
 		 924 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1713 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 645 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 757 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 1195 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2689  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 624 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1194 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1847 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  29.91 
 
 		 931 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1027 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 871 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1322 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1310  histidine kinase  36.22 
 
 		 927 aa  63.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28038  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  39.32 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1788 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  30.47 
 
 		 2312 aa  63.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  36.29 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.07 
 
 		 715 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  34.4 
 
 		 919 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32 
 
 		 1442 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1145 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1162 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 639 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1843 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  33.88 
 
 		 698 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  33.07 
 
 		 1351 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  32.23 
 
 		 891 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 452 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 636 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.64 
 
 		 655 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 406 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1214 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 801 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 641 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 627 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 810 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1119 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1055 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.2 
 
 		 1347 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4108  diguanylate cyclase  34.4 
 
 		 320 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.87577  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 874 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 932 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 452 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1853 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 695 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0286  histidine kinase  30.16 
 
 		 885 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 957 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1765  histidine kinase  32.56 
 
 		 462 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595997  normal  0.0193451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  33.86 
 
 		 1161 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1124 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1406 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 1066 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>