More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0863 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  43.18 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  39.69 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  39.69 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  36.72 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  34.92 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  32.82 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  34.11 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 717 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  35.38 
 
 		 445 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 801 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 641 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  36.84 
 
 		 977 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1033 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  33.86 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  32.81 
 
 		 955 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1054 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1788 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1713 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 762 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  33.33 
 
 		 666 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 754 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 685 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 614 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  31.5 
 
 		 891 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1042 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 		 924 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 745 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.43 
 
 		 1346 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 812 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1195 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1165 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  30.71 
 
 		 544 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1021 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1917 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4239  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  32.03 
 
 		 1351 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1005 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 944 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 921 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1452 aa  60.8  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  32.03 
 
 		 979 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5142  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1680 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 803 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 752 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 1038 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  33.86 
 
 		 226 aa  60.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 859 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  32.03 
 
 		 1161 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 945 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1691 aa  60.1  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1064 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1284 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 1550 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1055 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1040 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1333 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3093  histidine kinase  35.16 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.2154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  34.13 
 
 		 1418 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  36.22 
 
 		 1137 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1137 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 991 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 974 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  35.58 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 710 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2375  histidine kinase  32.03 
 
 		 806 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.824997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 1326 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 645 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 878 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1195 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 962 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1159 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  30.71 
 
 		 519 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 687 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 593 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 879 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 765 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>