More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4540 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  44.09 
 
 		 136 aa  123  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  39.52 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  36.79 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  33.07 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 745 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 752 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0109  response regulator receiver  37.19 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000662688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1287 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 685 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3971  hypothetical protein  35.54 
 
 		 224 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09008  PhytochromePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5K039]  29.6 
 
 		 1280 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 635 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 928 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  37.7 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.71 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.91 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1874  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254038  normal  0.519638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  28.12 
 
 		 667 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 757 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  26.56 
 
 		 650 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1070 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 635 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.02 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03214  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 		 852 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal  0.573276 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1017  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.246569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  32.03 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3977  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3241  two-component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.582303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1765  histidine kinase  32.56 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595997  normal  0.0193451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  32.82 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  31.78 
 
 		 647 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2960  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.88 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  33.61 
 
 		 1427 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 923 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  46.58 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3089  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0429158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 614 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  31.82 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0710  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00420398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  35.54 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1027 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1121 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  34.11 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 923 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1845  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  30.65 
 
 		 578 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  32.76 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  32.81 
 
 		 588 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  32.03 
 
 		 828 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  33.06 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 754 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  29.91 
 
 		 698 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2737  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00154696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 1003 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 923 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.58 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  34.62 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  31.97 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>