More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1975 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  268  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  96.95 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  40.46 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  38.93 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  32.31 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  30.3 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  38.98 
 
 		 1133 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  38.98 
 
 		 1130 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 1526 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 754 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  34.65 
 
 		 650 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1271 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 674 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 924 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1260 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.21 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0359  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.579751  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03400  two-component sensor molecule, putative  30.52 
 
 		 1617 aa  61.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.64378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 957 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  33.07 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1326 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 752 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1075 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0917  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  38.14 
 
 		 705 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.03 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1310 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 572 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  31.54 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1363 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 948 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 803 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 846 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  35.16 
 
 		 667 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 1713 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  34.4 
 
 		 680 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1009 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  29.01 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01273  putative two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid  35.2 
 
 		 702 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 685 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.92 
 
 		 1442 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 927 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 745 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3741  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 		 932 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 810 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  35.25 
 
 		 1119 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  34.11 
 
 		 1212 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1179  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2264  response regulator receiver  32.54 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  37.6 
 
 		 925 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0533  histidine kinase  30.89 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1078 aa  57.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1033 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 645 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1643 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  37.6 
 
 		 925 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 893 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1120 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.5 
 
 		 772 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 691 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2735  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.089268  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 510 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  37.84 
 
 		 919 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  31.25 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 		 1177 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  34.11 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  32.26 
 
 		 891 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  29.69 
 
 		 955 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 219 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>