More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0617 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  268  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  69.23 
 
 		 131 aa  197  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  67.18 
 
 		 136 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  62.31 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  47.33 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  44.7 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  43.51 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  49.62 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  45.8 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  46.56 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  45.04 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  44.62 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  41.54 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  39.37 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 745 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 757 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 752 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  37.21 
 
 		 828 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  33.6 
 
 		 650 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01800  Two-component system protein B Precursor (EC 2.7.13.3)(Protein NHK1)(SLN1 homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P4U6]  27.91 
 
 		 1065 aa  67.4  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1615  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 228 aa  67  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000138875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 962 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 636 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5142  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.17 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 649 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  32.03 
 
 		 698 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 1791 aa  63.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 841 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  33.61 
 
 		 919 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 754 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  36.28 
 
 		 891 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  32.84 
 
 		 571 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  37.39 
 
 		 460 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 717 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 645 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 1711 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  31.54 
 
 		 765 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  32.84 
 
 		 571 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1285 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 232 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  30.16 
 
 		 558 aa  60.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  31.06 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 		 703 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1005 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.06 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.06 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1713 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1234  EAL domain protein  30.15 
 
 		 589 aa  60.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.89994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.06 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0616  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 766 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0116444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 925 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2642  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 950 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1723  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  32 
 
 		 285 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 947 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 896 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0308  putative response regulator  34.4 
 
 		 506 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6806  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.23 
 
 		 575 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1044 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.03 
 
 		 1193 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 641 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 877 aa  60.1  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1075 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  33.91 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  34.48 
 
 		 1922 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  35.25 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 1383 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 1054 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 612 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1691 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>